Biologisk er et dyr en levende ting, der ikke er et menneske eller en plante. En fugl er klassificeret i kongeriget animalia hvilket betyder, at det også er et dyr. På trods af det faktum, at fugle er dyr, har de unikke anatomiske og fysiologiske egenskaber, der adskiller dem fra resten af dyrene. De vigtigste tydelige forskelle mellem dyr og fugle inkluderer:
En næb er en ekstern anatomisk struktur, der findes hos fugle. De fleste dyr har tænder, stærke kæber og poter for at angribe deres bytte. På den anden side har fugle næb, som de bruger til at undersøge mad, dræbe rovdyr, spise, pleje og også for at fodre deres små. Nebbet er en unik identifikation af fugle fra andre dyr.
De fleste dyr har deres knogler tilpasset for eksempel bevægelse på overfladen; at gå er dominerende. Imidlertid er fugle deres skeletter ændret til flyvning. De fleste fugle har letvægtsskeletter, og deres knogler mangler knoglemarv (hule knogler). I modsætning til andre dyr har fuglene de to clavicles smeltet og danner furcula eller knogleønsket, hvilket er både fleksibelt og stærkt nok til at understøtte skulderbeltet under flapping. De mange smeltede knogler hos fugle inklusive kraveben og knogleønsket gør skelettet fleksibelt til flyvning. Fugle har også deres brystben større end de andre kropsdele. Det store brystben leverer robuste fastgørelsespunkter på vingemuskler. Af denne grund er fugle ofte forskellige fra andre dyr.
Alle chordatas (dyr, der har rygrad), bortset fra fugle, har knoglemarv inden i deres knogler. Fugle har knoglerum, der er fyldt med luft i stedet for knoglemarven. Disse hulrum forbinder lungerne i luftvejene. Denne unikke egenskab gør det muligt for fugle, i modsætning til de fleste af dyrene, at blive luftbårne (i stand til at flyve) på trods af gravitationseffekten.
Det er biologisk bevist, at det fra alle andre dyr kun er fugle, der ikke har en membran. I stedet for membranen har fugle luftsække. Luftsække er rum inden i fuglen, hvor der er konstant tilstedeværelse af luft. Luft bevæges ind og ud af fuglens åndedrætssystem gennem trykændringer i luftsækkene. Luftsækkene strækker sig også ind i nogle knoglehulrum, og dette gør fuglenes åndedrætsorgan mere effektiv. Luftsække hjælper også med at holde fugle kølige ved at udvise varme; dette er ganske nyttigt, fordi fugle ikke sveder.
Andre grupper af dyr har hele deres kroppe dækket pels eller vægt. Fugle skiller sig ud for at være forskellige eller unikke fra resten af dyrene; det er nu bevist, at fugle er de eneste levende væsener, der har fjer. Fugle har to typer flyvefjere, der findes på vingerne: trykproducerende fjer i spidsen af vingen og løft, der giver sekundære fjer. Ikke kun flyver, fugle bruger deres fjer til forskellige formål, såsom: regulering af kropstemperaturer, camouflering, tiltrækning af kammerater, territoriel dominans blandt andre.
Dyrene har deres forben tilpasset forskelligt afhængigt af deres miljø. Det er tydeligt, at de fleste af dyrene har deres forben tilpasset til at gå. På trods af dette har fugle deres forben tilpasset til at flyve. De ændrede forben på fugle kaldes vinger. Fugle bruger vingerne primært til at flyve, selvom de også bruger dem til at regulere kropstemperaturerne. Ikke alle dyr, der har vinger, men alle fugle har vinger.
Det kan generelt konkluderes, at fugle er meget forskellige sammenlignet med andre dyr.