Naturen består af utallige levende organismer, som er forskellige og varierede i mange aspekter. Ud af alle de levende organismer er bakterier de mest rigelige levende arter, der findes næsten overalt, i luften vi indånder, den mad, vi spiser og endda i det vand, vi drikker. Det er vanskeligt at forestille sig, at der også er en enorm population af bakterier, der lever i vores krop, hvilket er meget gavnligt for os. Protister er på den anden side en meget forskelligartet gruppe af organismer, der også findes bredt i miljøet, men altid i fugtige omgivelser. Som alle andre levende organismer har de også et behov for mad til energi. Begge disse organismer er mikroskopiske organismer, der kan skade så godt som godt for mennesker.
Bakterier er enkeltcellede organismer, der har en enkel celle med et meget lavt niveau af celledifferentiering. Bakterier vokser enten som en enkelt celle eller i en koloni af celler. De kan få deres mad på forskellige måder. De kan producere deres egen mad og gøre dem kendt som producenter, eller når de er afhængige af andre organismer til mad, de er kendt som forbrugere. Nogle kan bevæge sig ved hjælp af flagella eller fimbrialignende strukturer, mens andre er umotiske.
Protister er de mest forskellige organismer, og de er meget vanskelige at klassificere, da nogle af dem har plantelignende, dyrelignende eller svampelignende egenskaber. De er mere udviklede end bakterier, således at de viser en højere grad af cellestrukturdifferentiering. Protister er mere komplekse sammenlignet med bakterier.
Selvom begge disse levende organismer har udviklet sig fra de samme forfædre, er der visse nøgleforskelle, der adskiller dem.
Bakterier er de ældste organismer, der vides at eksistere på jorden. De hører til det ældste kongerige Monera, mens protister er klassificeret som Kingdom Protista. De har organismer, der viser egenskaber, der ligner dyr, planter eller svampe. Således opdelt de yderligere i 3 kategorier, dvs. plantelignende protister, dyrelignende protister eller svampelignende protister.
Bakterier er encellede organismer, og deres cellestruktur er meget enkel. Der er ingen kerne, der er en celle's hovedkontroller. DNA'et, som er det genetiske materiale, er spredt i cellen. Da de ikke indeholder en kerne, er de kendt som prokaryote organismer. De indeholder ikke små specialiserede mindre organer kendt som organeller. De kan være stangformede, spiralformede, sfæriske, kædelignende osv.
Protister kan enten være encellede eller flercellede. De indeholder en kerne samt specialiserede mindre organeller. Derudover er deres genetiske materiale kompakt inden i en konvolut.
Bakterier findes praktisk talt overalt. De udgør en stor del af befolkningen i miljøet. Protister findes kun i fugtige omgivelser.
Selvom det er kendt at bakterier forårsager sygdomme hos mennesker, er de også fordelagtige på mange måder. De opretholder en sund balance i miljøet. De opretholder fødekæden i miljøet ved en proces med genanvendelse af næringsstoffer. De findes også i den menneskelige tarm og opretholder sundheden ved at producere vitamin K og vitamin B12. De bruges i industrier til fremstilling af brød, alkohol, yoghurt og ost.
Protister er lige så vigtige for at opretholde en ligevægt i økosystemet. De er ansvarlige for at levere ilt, der er nødvendigt for vejrtrækning.
Bakterier og protister er begge vigtige levende organismer, der går på kompromis med en stor del af vores omgivelser. Selvom de har udviklet sig fra fælles forfædre, er der visse vitale forskelle, der viser udviklingsprocessen mellem begge organismer. Protister har en stærkt udviklet og veldefineret cellestruktur sammenlignet med bakterier. Protister findes kun i fugtige omgivelser, mens bakterier findes overalt. Bakterier er encellede, mens protister kan være encellede eller multicellulære.