Selvom begge repræsenterer alternative lægemidler, er det underligt, hvordan troende på disse to off-off-lægevidenskaber aldrig sammenlignede det ene med det andet, men altid med allopatiske lægemidler.
Ayurvedikere har været i praksis i det sydøstlige Asien i ioner, mens homøopati har været i praksis i tre århundreder. Begge følger forskellige filosofier for helbredelse af sygdomme. Mens en ayurvedisk medicin supplerer de videnskabelige allopatiske lægemidler, er homeopati imod den. Troende på ayurvediske lægemidler hævder, at det at være naturligt ikke kan skade en.
Ayurveda tror på at forebygge sygdom, mens homøopati er baseret på at helbrede en sygdom. Yoga, en del af ayurvedisk medicinsk form, bruges over hele verden som en behandlingsform og accepteres bredt af det videnskabelige samfund. I ayurvedisk medicin anvendes urter og massage til nød og berømmes for at være mere naturlige.
I Ayurveda antages det, at man kan forblive fri for enhver sygdom ved at holde toksinerne ude af kroppen. Det anvender også både orale lægemidler fremstillet af urter og krydderier og kirurgiske procedurer for at skylle giftstoffer ud af kroppen; derved kurere sygdomme og forskellige lidelser. I homøopati helbredes sygdomme ved at introducere symptomer, der ligner sygdommens sygdomme i en meget fortyndet form. Det antages, at dette vil hjælpe livskraften med at neutralisere sygdommen og dermed helbrede patienten.
I henhold til filosofien om homøopati er sygdomme ikke kontaktet, men har altid været til stede i os. Det antages af udøvere af homeopati, at disse forstyrrelser i livskraften er de vigtigste årsager til sygdomme og bør rettes for at helbrede sygdommene.
Selvom både Ayurveda og Homeopati tror på vigtigheden af et positivt sind, adskiller de sig meget i deres behandlingsformer. Homøopati har altid været kritisk over for allopatiske lægemidler og mener, at de sygdomme, der er behandlet med allopatiske lægemidler, aldrig forlader kroppen fuldstændigt, men at de bare forsvinder af dem, og sygdommene vil vende tilbage, når virkningen af disse lægemidler slides..
Gyldigheden af disse medikamenter forbliver altid ubestridt uden nogen side, der har relation til den anden.