Agarose og Polyacrylamid er begge vandopløselige polymerer, men mellem dem kan der ses mange forskelle fra deres oprindelse. Både Agarose og Polyacrylamide har noget fælles i deres evne til at danne porøse gelmatrixer. På trods af dette findes der en række forskellige forskelle mellem de to. De største forskelle mellem begge disse polymerer ligger i deres oprindelsesart, kemiske struktur, deres forskellige anvendelser og deres ydeevne med hensyn til gelelektroforese.
Agarose er en naturligt forekommende lineær polymer, der igen er afledt af en kompleks polymer kaldet agar, der findes i tang. Agarose ekstraheres fra agar ved fjernelse af dens proteinkomponent, der kaldes agaropectin. Agarose er det, der giver agar dens evne til at danne geler.
Den væsentligste anvendelse af agarose er i mikrobiologiske og molekylærbiologiske studier. I mikrobiologiske studier giver agarose, når den suppleres med passende næringsstoffer, en solid base til dyrkning af mikroorganismer, såsom bakterier og svampe. Når det bruges i halvfaste koncentrationer, kan det være nyttigt til vurdering af disse mikroorganismeres bevægelighed. I molekylærbiologi fungerer det som et vigtigt værktøj til en af de mest grundlæggende opløsnings-processer kaldet 'gelelektroforese'eller'agarosegelelektroforese'(ALDER). Gelelektroforese er en proces, der tillader opløsning eller adskillelse af nukleinsyrer eller protein baseret på deres størrelse og ladning. Her tjener agarose som en porøs sigte-lignende gel, gennem hvilken adskillelse sker.
Agarosestruktur
Polyacrylamid er en syntetisk polymer og bruges i en lang række industrier. Som tidligere nævnt afhænger dens anvendelse af dens evne til at danne geler. Ud over dette udnyttes dets evne til at tilbageholde og dræne vand i forskellige koncentrationer også i forskellige industrier.
Den mest udbredte og almindelig anvendelse af polyacrylamid er i spildevandsrensning. Her bruges det som flokkuleringsmiddel til fjernelse af ethvert suspenderet organisk materiale; dermed forbedring af uklarhed og klargøring af vandet. En anden anvendelse af polyacrylamid er i papirindustrien. Her bruges det til enten at tilbageholde eller dræne vand fra papirmassen efter behov. Tilsvarende bruges det i landbrugs- og byggebranchen som jordbalsam for at forhindre jorderosion og forbedre dens kvalitet.
Ligesom agarose bruges også polyacrylamid i molekylærbiologi som et vigtigt opløsningsværktøj i en lignende proces kaldet 'Polyacrylamidgelelektroforese '(PAGE). Ud over alt dette bruges polyacrylamid også til malmbehandling og fremstilling af flokkuleringsmiddel til fjernelse af ethvert suspenderet organisk materiale; dermed forbedring af uklarhed og klargøring af vandet. En anden anvendelse af polyacrylamid er i papirindustrien. Her bruges det til enten at tilbageholde eller dræne vand fra papirmassen efter behov. Tilsvarende bruges det i landbrugs- og byggebranchen som jordbalsam for at forhindre jorderosion og forbedre dens kvalitet. Ud over alt dette bruges polyacrylamid også til fremstilling af fødevaretilsætningsstoffer, bløde kontaktlinser og tekstiler.
Polyacrylamidstruktur
Agarose: Agarose er en polymer af naturlig oprindelse. Det stammer fra tang.
polyacrylamid: Polyacrylamid er af syntetisk oprindelse og findes ikke under nogen naturlig omstændighed.
Agarose: Den molekylære formel for agarose er C24H38O19.
polyacrylamid: Den molekylære formel for polyacrylamid er (C 3H5INGEN)n.
Agarose: Agarose er et lineært polysaccharid. Det består af gentagne disaccharidenheder kaldet agrobiose holdt sammen af brintbindinger.
polyacrylamid: Polyacrylamid er en kemisk tværbundet polymer. Det består af acrylamidmonomerer og et tværbindingsmiddel N, N'-methylenbisacrylamid.
Agarose: Både agarose og dens monomerenhedsagrobiose er ikke-toksiske.
polyacrylamid: Monomerenheden af polyacrylamid, acrylamid, er et formodet kræftfremkaldende stof og kendt neurotoksin, medens det er polymeriseret form er ikke-toksisk..
Agarose: Agarosegelepræparat til AGE er mindre tidskrævende, let og enkelt og kræver ikke en initiator eller polymeriseringskatalysator.
polyacrylamid: Polyacrylamidgelpræparat til PAGE er tidskrævende og trættende og kræver også en initiator (ammoniumpersulfat) og en polymeriseringskatalysator (N, N, N ', N'-tetramethylethylendiamin - TEMED).
Polyacrylamidgeler er kemisk mere stabile end agarosegeler.
I betragtning af den samme koncentration har polyacrylamidgelmatrixer en tendens til at have mindre porestørrelser sammenlignet med den for en agarosegelematrix.
Porestørrelsen af polyacrylamidgeler kan ændres på en mere kontrolleret måde end for agarosegeler.
Polyacrylamidgeler har høj opløsningsevne, mens agarosegeler har lav opløsningsevne.
Polyacrylamidgeler kan rumme større mængder nukleinsyre end agarosegeler til opløsningsmidler.
Billeder høflighed: Agarose og struktur af polyacrylamid via Wikicommons (Public Domain)