Forskellen mellem Cosmid og Phagemid

Det vigtigste forskel mellem Cosmid og Phagemid er på den type sekvenser, den indeholder. En Cosmid indeholder et cos-sted og et plasmid. Derfor er det en hybridvektor, medens en Phagemid er et plasmid, der indeholder et Fl-replikationsorigin af F1-fagen.

Kosmider og fagmider bruges til kloning, især til at klone større fragmenter af DNA. Disse er vidt brugt især til kloning af gener, der er ansvarlige for produktionen af ​​forskellige proteiner. Kosmider og phagemider replikeres enten alene som plasmider eller pakkes i virale partikler og replikeres derefter.

INDHOLD

1. Oversigt og nøgleforskel
2. Hvad er en kosmid
3. Hvad er en phagemid
4. Ligheder mellem Cosmid og Phagemid
5. Sammenligning side ved side - Cosmid vs Phagemid i tabelform
6. Resume

Hvad er en kosmid?

Et Cosmid, kaldet et hybridplasmid, omfatter cos-steder ekstraheret fra Lambda-fagpartikler og et plasmid. Disse cos-steder er lange fragmenter af DNA med 200 basepar. Derfor har de sammenhængende eller klæbrige ender, der tillader plasmidet at passe ind i det virale DNA. Derfor er cos-stederne afgørende for emballering af DNA.

Der er tre cos-steder;

• cosN-sted - involveret i nicking af DNA-strengen ved terminase-aktivitet
• cosB-sted - engageret i at holde terminalen.
• cosQ-sted - involveret i at forhindre nedbrydning af DNA'et af DNaser.

Figur 01: Cosmid

Cosmider kan også enten replikere enkeltstrenget DNA eller dobbeltstrenget DNA under anvendelse af et passende replikationsorigin. Kosmider indeholder normalt antibiotiske resistensgener som markører til udvælgelse af transformanter. Anvendelse af et kosmid som en vektor kan således lette kloning, og restriktionsenzymfordøjelsen af ​​vektoren kan derefter ekstrahere disse fragmenter.

Hvad er en phagemid (phasmid-)?

Phagemid, også kaldet phasmid-, er også en type hybridvektor. Phagemid indeholder en speciel replikationsorigin betegnet som replikationens oprindelsesstørrelse. Replikationens oprindelsessteds f1 fra en f1-fag.

Phagemid kan replikere både enkeltstrenget og dobbeltstrenget DNA. Replikation kan enten finde sted som et plasmid, mens den gennemgår uafhængig replikation, eller kan pakkes i fagpartikler og endelig inficere bakterievært E coli. Ved infektion af E coli celler, kræver f1-fagen tilstedeværelse af en pilus. Derfor er sexpili vigtig i løbet af in vitro emballage af phagemider.

Hvad er ligheden mellem Cosmid og Phagemid?

• Både Cosmid og Phagemid er kloningsvektorer anvendt i rekombinant DNA-teknologi.
• Cosmid og Phagemid kan replikere enkeltstrenget og dobbeltstrenget DNA.
• Begge kan gennemgå uafhængig replikation svarende til plasmider.
• Kosmid og phagemid kan gennemgå in vitro emballering og inficering af bakterieceller.
• Både Cosmid og Phagemid kræver et passende replikationsorigin til kloning.

Hvad er forskellen mellem Cosmid og Phagemid?

Cosmid vs Phagemid
Cosmid er en hybridvektor, der indeholder et cos-sted og et plasmid.	Phagemid er et plasmid, der indeholder et F1-replikationsstartsted for F1-fagen.
Tilstedeværelse af Cos-websteder
Cos-steder findes i kosmid og er nødvendige til in vitro-emballage.	Cos-steder er fraværende i phagemid.
Tilstedeværelse af replikationens oprindelse F1
I kosmid kan fi-replikationens oprindelse muligvis ikke være til stede.	F1-replikationsorigin er til stede i fagmid.
Tilstedeværelse af antibiotikaresistente gener
Antibiotikumresistente gener er til stede i kosmider for at identificere transformanterne fra ikke - transformanter.	Antibiotikumresistente gener er fraværende i fagmider.
Krav til in vitro-emballage
Kræver et cos-sted.	Kræver en sexpilus.

Resumé - Cosmid vs phagemid

Cosmid og Phagemid er kloningsvektorer anvendt i rekombinant DNA-teknologi. Kosmider er hybridvektorer, der indeholder specielle klæbrige ender kendt som cos-steder. in vitro emballage kræver disse cos-websteder. Mens fagmider er plasmider, der indeholder et f1-replikationsorigin ekstraheret fra f1-fag. Både kosmid og fagemid kan gennemgå uafhængig replikation eller in vitro emballering til bakterieceller. Dette er de vigtige forskelle mellem kosmid og fagmid.

Reference:

1.Qi, H, et al. “Phagemid-vektorer til fagvisning: Egenskaber, egenskaber og konstruktion.” Journal of Molecular Biology., U.S. National Library of Medicine, 30. mar. 2012. Tilgængelig her 
2.Collins, J og B Hohn. “Kosmider: en type plasmidgenkloningsvektor, der kan pakkes in vitro på bakteriofag-lamdahoveder.” Proces of the National Academy of Sciences of the United States of America, U.S. National Library of Medicine, september 1978. Tilgængelig her  

Billede høflighed:

1.'Cosmid (engelsk) 'Af Zlir'a (CC0) via Commons Wikimedia