Forskel mellem Ferredoxin og Rubredoxin
Share
Det vigtigste forskel mellem ferredoxin og Rubredoxin er det ferredoxin har et betydeligt lavere redoxpotentiale sammenlignet med Rubredoxin.
Både ferredoxin og Rubredoxin er jernholdige proteiner. Vi kan dog finde ferredoxin i bakterieformer og i planter, fordi det er et chloroplast-protein. Imidlertid er Rubredoxin et protein, der kun forekommer i bakterier og archaea. Disse to forbindelser har en tæt lignende struktur.
INDHOLD
1. Oversigt og nøgleforskel
2. Hvad er Ferredoxin
3. Hvad er Rubredoxin
4. Sammenligning side ved side - Ferredoxin vs Rubredoxin i tabelform
5. Resume
Hvad er Ferredoxin?
Ferredoxin er et jern-svovlholdigt protein. Det er involveret i at formidle elektronoverførslen i forskellige metaboliske reaktioner. Dette er små proteiner, der er vandopløselige, og de findes i chloroplaster. Jern- og svovlatomerne i dette protein er arrangeret i jern-svovlklynger. De kan fungere som biologiske kondensatorer ved at acceptere og aflade elektroner. Her ændres oxidationstilstanden for jernatomer fra +2 til +3. Derfor fungerer de som elektronoverførende midler i redoxreaktioner, der finder sted i et biologisk miljø. Til sammenligning er redoxpotentialet for dette protein lavt. Et ferredoxin-proteinmolekyle kan indeholde to, tre eller fire jernatomer pr. Proteinmolekyle. Der er tre almindelige typer ferredoxiner: Fe2S2 ferredoxiner, Fe4S4 ferredoxiner og Fe3S4 ferredoxiner.
Ferredoxins vigtigste rolle er at allokere højenergi-elektroner i chloroplasten, og disse proteiner er involveret i distribution af elektroner, der kræves til kuldioxidfiksering, nitrilreduktion, sulfitreduktion, glutamatsyntese, cyklisk elektronstrøm osv..
Hvad er Rubredoxin?
Rubredoxin er et jernholdigt protein, der kan findes i bakterier og archaea. Det er en type protein med lav molekylvægt (normalt er proteiner forbindelser med høj molekylvægt). I modsætning til ferredoxin indeholder Rubredoxin-protein imidlertid ikke uorganiske sulfider. Rubredoxins vigtigste rolle er, at det deltager i elektronoverførselsmekanismer i redoxreaktioner, der forekommer i biologiske systemer.
Når man overvejer strukturen af Rubredoxin, indeholder det et centralt jernatom, der har næsten en tetraedrisk geometri. De fire grupper, der er bundet til dette jernatom, er cysteinrester. Størstedelen af Rubredoxin-proteiner er vandopløselige kemiske arter. Der er dog nogle uopløselige arter, der findes som membranbundne proteiner. F.eks. Rubredoxin-A.
Under elektronoverførselsmekanismen ændres oxidationstilstanden for det centrale jernatom fra +2 til +3. Vi kan let genkende denne ændring i oxidationstilstand, fordi farven skifter fra rød til farveløs. Under denne ændring forbliver metalionen i en høj-spin tilstand, fordi det er nyttigt at minimere de strukturelle ændringer af proteinet. Typisk er reduktionspotentialet for Rubredoxin højere end ferredoxin; det er i området fra +50 mV til -50 mV.
Hvad er forskellen mellem Ferredoxin og Rubredoxin?
Ferredoxin og Rubredoxin er proteinforbindelser, der indeholder både jern og svovl som komponenter. Den vigtigste forskel mellem ferredoxin og Rubredoxin er, at ferredoxin har et betydeligt lavere redoxpotentiale sammenlignet med Rubredoxin. Ferredoxins redoxpotentiale er ca. -420 mV, og redoxpotentialet for Rubredoxin spænder fra -50 til +50 mV. Yderligere kan ferredoxin indeholde to, tre eller fire jernatomer pr. Proteinmolekyle, men i Rubredoxin er der et centralt jernatom. Begge disse molekyler har imidlertid en tæt lignende tetrahedral geometri omkring jernatomer.
Ferredoxin indeholder desuden uorganisk svovl som en bestanddel i proteinmolekylet, men der er ikke noget uorganisk svovl i Rubredoxin. Når man overvejer forekomsten, kan ferredoxin forekomme i både bakterieformer og i planter, men Rubredoxin forekommer i bakterier og archaea.
Tabellen nedenfor opsummerer forskellen mellem ferredoxin og Rubredoxin.
Resume - Ferredoxin vs Rubredoxin
Ferredoxin og Rubredoxin er proteinforbindelser, der indeholder både jern og svovl som komponenter. Den vigtigste forskel mellem ferredoxin og Rubredoxin er, at ferredoxin har et betydeligt lavere redoxpotentiale sammenlignet med Rubredoxin.
Reference:
1. Chipperfield, J.r. “JERN | Egenskaber og bestemmelse. ” Encyclopedia of Food Sciences and Nutrition, 2003, s. 3367-3373., Doi: 10.1016 / b0-12-227055-x / 00650-7.
Billede høflighed:
1. “3P1M.pdb1” Af Jmol Development team - Jmol (CC0) via Commons Wikimedia
2. “PDB 1s24 EBI” Af Jawahar Swaminathan og MSD-personale ved Det Europæiske Bioinformatikinstitut - (Public Domain) via Commons Wikimedia
