Polymerase-kædereaktion (PCR) er en DNA-amplificeringsmetode, der anvendes i molekylærbiologiske applikationer. Det er en almindeligt anvendt teknik, der laver millioner til milliarder af kopier af en særlig interesseret DNA-sekvens. Det er en in vitro metode udført i laboratorier. PCR-teknik er helt afhængig af den kommercielt producerede DNA-polymerase kaldet Taq-polymerase. Og det kræver også flere andre komponenter og korrekt temperaturvedligeholdelse. En vigtig komponent er primere. Primere er de korte DNA-sekvenser, der specifikt er designet til mål-DNA-sekvensen. De er normalt omkring 20 nukleotider i længde. Taq-polymerase katalyserer tilsætningen af nukleotider til den forudgående eksisterende nukleotidsekvens. Derfor tjenes primere som udgangspunkt for syntesen af nye strenge. Taq-polymerase fungerer kun i 5 'til 3' retning, og derfor finder DNA-syntesen sted i den samme 5 'til 3' retning. Da DNA er dobbeltstrenget, er to typer primere nødvendige i PCR. De er kendt som forreste primer og omvendt primer. Fremadgående og bagudgående primere kaldes baseret på retningen for forlængelsen af primeren i DNA, når DNA-syntese finder sted. Fremad primer annealer med antisense-DNA-strengen og initierer syntesen af + ve-streng af genet i 5 'til 3' retning. Omvendt primer annealer med sensstrengen og initierer syntesen af den komplementære streng af den kodende streng; som er fra genet af strengen i 5 til 3 'retning. Dette er vigtigste forskel mellem forreste og bagudgående primere.
1. Oversigt og nøgleforskel
2. Hvad er en fremadrettet grunning
3. Hvad er en omvendt primer
4. Ligheder mellem fremad og omvendt grunning
5. Sammenligning side ved side - Fremad mod omvendt primer i tabelform
6. Resume
Fremadorientering er syntesen af den kodende streng eller sensens streng af et gen. Taq-polymerase katalyserer syntesen af en ny streng i 5 'til 3' retning. Syntese af kodende streng sker, når primeren annealer med den ikke-kodende eller antisense-streng og forlænger i 5 'til 3' retning.
Figur 01: Fremad- og bagudgående primere
Primeren, der annealer med antisense-strengen eller den ikke-kodende streng eller skabelonstrengen er kendt som fremad-primer, da fremad-primer fungerer som udgangspunkt for syntesen af kodning eller den positive streng af genet. Fremadgrunder har en kort nukleotidsekvens, der er komplementær til den 3'-flankerende ende af antisense-strengen. Det hybridiserer med antisense-strengen og letter Taq-polymerasen til at tilføje nukleotider, der er komplementære til skabelonstrengen.
Omvendt primer er den korte DNA-sekvens, der anneales med 3'-enden af sensstrengen eller den kodende streng. Omvendt primer tjener som udgangspunkt for at syntetisere en komplementær streng af den kodende sekvens eller den ikke-kodende sekvens. Omvendt primer er designet komplementært til 3'-enden af den kodende streng. Derfor anneales det med den flankerende 3'-ende af den kodende streng og tillader Taq-polymerase at syntetisere antisense-strengen eller skabelonstrengen. Da dens orientering er på en omvendt måde, er denne primer mærket som omvendt primer.
Både revers og fremadgående primere er vigtige for produktionen af millioner til milliarder af kopier af bestemte regioner af DNA, der er målrettet eller interesseret.
Forward Primer vs Reverse Primer | |
Fremad-primer er den korte DNA-sekvens, der hybridiserer med 3'-enden af den ikke-kodende eller templatestrengen af genet og tjener som udgangspunkt for syntese af den kodende sekvens. | Omvendt primer er den korte DNA-sekvens, der hybridiserer med 3'-enden af den kodende eller ikke-eksemplerede streng og tjener som udgangspunkt for at syntetisere den ikke-kodende sekvens. |
Udglødning Strand | |
Fremadgrunder glødes med skabelonstreng. | Omvendt primer glødes med den ikke-eksemplerede streng. |
Resultatet er ny sekvens | |
Fremadgrunder letter syntese af den kodende sekvens. | Omvendt primer letter syntese af den ikke-kodende sekvens. |
Der er to typer primere involveret i PCR-teknik. De er fremadgående og omvendte primere. Baseret på forlængelsen af primeren i ny DNA-streng-syntese er disse primere mærket eller navngivet. Taq-polymerase syntetiserer det nye DNA i 5 'til 3' orientering. Derfor er primere designet som komplementære til 3'-ender af dobbeltstrenge. Fremad primer, der forlænger i 5 'til 3' retning, hybridiserer med 3'-enden af antisense eller skabelonen eller den ikke-kodende sekvens. Det fungerer som udgangspunkt for syntese af kodesekvens. Omvendt primer, der forlænger i 5 'til 3' retning, hybridiserer med 3'-enden af kodningen eller ikke-eksemplet eller sansestrengen. Det tjener som udgangspunkt for at syntetisere den ikke-kodende sekvens. Dette er forskellen mellem frem og baglæns primer.
1. "Primer (molekylærbiologi)." Wikipedia, Wikimedia Foundation, 20. februar 2018. Tilgængelig her
2. "Polymerasekædereaktion (PCR)." Khan Academy. Tilgængelig her
1.'Primers RevComp Melted2'By Richard Wheeler (Zephyris) - Eget arbejde, (CC BY-SA 3.0) via Commons Wikimedia