Forskel mellem generelle og specifikke transskriptionsfaktorer

Nøgleforskel - Generelt vs specifikke transkriptionsfaktorer

Transkriptionsfaktorer kræves af RNA-polymerase til at virke på DNA-templatstrengen ved syntese af mRNA. Der er forskellige typer transkriptionsfaktorer. Disse transkriptionsfaktorer danner et kompleks med DNA-strengen. De ændrer enten bekræftelsen af skabelonstrengen eller øger RNA-polymeraseenzymets affinitet mod mRNA-syntese i processen med kaldet transkription. Der er to hovedtyper af transkriptionsfaktorer. Det er generelle eller basale transkriptionsfaktorer og de specifikke transskriptionsfaktorer. De generelle transkriptionsfaktorer er de faktorer, der bruges til at danne præ-initieringskomplekset under transkriptionsprocessen. De er til stede i næsten alle eukaryoter, og i prokaryoter danner de et mindre kompliceret kompleks. De specifikke transskriptionsfaktorer er enten enhancere eller repressorer, som er specifikke DNA-sekvenser, der aktiverer eller undertrykker den generelle transkriptionsproces. Nogle specifikke transkriptionsfaktorer kan ændre selve DNA-sekvensen. Det vigtigste forskel mellem de generelle transkriptionsfaktorer og de specifikke transskriptionsfaktorer er baseret på funktionaliteten. Generelle transkriptionsfaktorer er involveret i dannelsen af et præ-initieringskompleks af transkriptionsprocessen, hvorimod specifikke transskriptionsfaktorer deltager i enten aktivering eller undertrykkelse af transkriptionsprocessen.

INDHOLD

1. Oversigt og nøgleforskel
2. Hvad er generelle transskriptionsfaktorer
3. Hvad er specifikke transskriptionsfaktorer
4. Ligheder mellem generelle og specifikke transskriptionsfaktorer
5. Sammenligning side ved side - Generel kontra specifikke transskriptionsfaktorer i tabelform
6. Resume

Hvad er generelle transskriptionsfaktorer?

Generelt eller Basale transkriptionsfaktorer er de faktorer, der er involveret i dannelsen af initieringskomplekset under transkription. De er essentielle for transkriptionsprocessen, derfor spiller de en vigtig rolle i den vellykkede transkription. Der er seks centrale generelle transkriptionsfaktorer. De er; TFIID, TFIIB, TFIIH, TFIIE, TFIIF og TFIIA. De spiller forskellige roller under dannelsen af initieringskomplekset.

TFIID - Denne transkriptionsfaktor (TF) er involveret i genkendelse af promotorsekvensen (TATA-boks).
TFIIB - Promotoren / TFIID-komplekset genkendes af TFIIB. Dette tilvejebringer et signal til binding af det vigtigste katalyserende enzym RNA-polymerase.
TFIIF - Denne transkriptionsfaktor er bundet til RNA-polymerasen. TFIIF deltager således i processen ved at rekruttere RNA-polymerasen til det korrekte sted.
TFIIE og TFIIH - Bindingen af disse transkriptionsfaktorer markerer afslutningen på dannelsen af præ-initieringen Binding af disse øger effektiviteten af dannelsen af præ-initieringskomplekset.
TFIIA fremmer bindingen af TFIID til TATA-boksen.

Figur 01: Generelle transkriptionsfaktorer

Ovennævnte generelle transkriptionsfaktorer er specifikke for RNA-polymerase II, som er typen af RNA-polymerase, der forlænger mRNA-strengen. Der er generelle transkriptionsfaktorer involveret med RNA-polymerase I og III. Generelle transkriptionsfaktorer kan også variere afhængigt af den type celle, som den virker på.

Hvad er specifikke transskriptionsfaktorer?

Specifikke transkriptionsfaktorer er regioner, der også ligger i DNA-sekvenserne. De er for det meste enten enhancers eller repressors. Specifikke transkriptionsfaktorer er de specifikke cis-virkende elementer i skabelon-DNA-strengen, der gennemgår transkription. Aktivering af disse specifikke enhancere og repressorer deltager i at øge enzymets affinitet ved at ændre orienteringen af DNA-molekylet eller ved at fungere som signalregioner. Specifikke transkriptionsfaktorer bruges også til at inducere modifikationer af DNA-skabelonstrengen. Disse modifikationer involverer hovedsageligt kovalente modifikationer, såsom methylering. Derved fungerer methylerede DNA-regioner som specielle enhancere eller repressorer af transkriptionsprocessen.

Figur 02: Specifikke transkriptionsfaktorer

De specifikke transkriptionsfaktorer afhænger af typen af arter og findes ikke almindeligt i alle eukaryoter. Disse transkriptionsfaktorer aktiveres af forskellige metaboliske tilstande via signaltransduktionsveje. Efter aktivering regulerer de ekspressionen af genet på et transkriptionelt niveau.

Hvad er ligheden mellem generelle og specifikke transskriptionsfaktorer?

Begge faktorer er påkrævet i transkriptionsprocessen.
Begge faktorer påvirker genekspressionen af en organisme.
Begge faktorer er med til at regulere funktionen af RNA-polymerase i transkriptionsprocessen.
Begge faktorer findes mest i eukaryoter.

Hvad er forskellen mellem generelle og specifikke transskriptionsfaktorer?

Generel kontra specifik transkription
De generelle transkriptionsfaktorer er de faktorer, der bruges til at danne præ-initieringskomplekset under transkriptionsprocessen.	De specifikke transkriptionsfaktorer er enten enhancere eller repressorer, som er specifikke DNA-sekvenser, der aktiverer eller undertrykker den generelle transkriptionsproces.
Type molekyle
Generelle transkriptionsfaktorer er proteinbaserede.	Specifikke transkriptionsfaktorer er nukleotidsekvenser.
dannelse
Generelle transkriptionsfaktorer danner præ-initieringskomplekset under transkriptionstartningen.	Specifikke transskriptionsfaktorer fungerer som forstærkere eller repressorer af transkription.
typer
Der er seks hovedtyper; TFIID, TFIIB, TFIIH, TFIIF, TFIIE og TFIIA af generelle transkriptionsfaktorer.	Specifikke transskriptionsfaktorer er hovedsageligt kategoriseret som enhancers og repressors.

Resume - Generelt vs specifikke transkriptionsfaktorer

Transkriptionsfaktorer er vigtige for transkriptionel regulering og er nødvendige for den øgede effektivitet og nøjagtighed af processen. Transkriptionsfaktorer er to hovedtyper; Generelt / basalt og specifikt. Generelle transkriptionsfaktorer er involveret i dannelsen af præ-initieringskomplekset under transkription, hvorimod specifikke transkriptionsfaktorer er regioner i selve DNA'et, der fungerer som forstærkere eller repressorer. Generelle transkriptionsfaktorer er proteinbaserede og kræves af alle eukaryoter. Det varieres ikke vidt og forbliver som ensartede molekyler. En specifik transskriptionsfaktor kan variere vidt og afhænger af enkeltpersoners genetiske sammensætning. Dette er forskellen mellem generelle og specifikke transskriptionsfaktorer.

Download PDF-versionen af generelle kontra specifikke transskriptionsfaktorer

Du kan downloade PDF-version af denne artikel og bruge den til offline-formål som pr. Citatnotat. Download PDF-versionen her Forskel mellem generelle og specifikke transskriptionsfaktorer

Reference:

1.Pulverer, Bernd. "Sekvensspecifikke DNA-bindende transkriptionsfaktorer." Nature News, Nature Publishing Group. Tilgængelig her
2. "Transkriptionsfaktorer - Genspecifikke faktorer forbedrer forskelligt transkriptionstaksterne." DNA, bind, promotor og bind - JRank-artikler. Tilgængelig her
3. Orphanides, G, et al. “De generelle transkriptionsfaktorer for RNA-polymerase II.” Gen & udvikling, Cold Spring Harbor Lab. Tilgængelig her

Billede høflighed:

1.'Freinhedskompleks 'Af ArneLH - Eget arbejde, (CC BY-SA 3.0) via Commons Wikimedia
2. 'Roll af transkriptionsfaktor i genekspressionsregulering' Af Philippe Hupé - Emmanuel Barillot, Laurence Calzone, Philippe Hupé, Jean-Philippe Vert, Andrei Zinovyev, Computational Systems Biology of Cancer Chapman & Hall / CRC Mathematical & Computational Biology, 2012, (CC BY-SA 3.0) via Commons Wikimedia

Videnskab & natur