Det vigtigste forskel mellem genetisk kort og fysisk kort findes i de teknikker, der bruges i genomkortlægning. Ved generering af et genetisk kort bruges genetiske markører og genetiske loci til at studere genkoblingsmønstre, mens fysisk kortlægning anvender molekylærbiologiteknikker såsom Restriction Fragment Length Polymorphism (RFLP) og hybridiseringsteknikker.
Genetiske kort og fysiske kort to typer kort, der konstruerer til at vise generne placeret i kromosomer. De involverer i genetisk diagnostik og for at forudsige udvikling med hensyn til genomanalyse. Desuden bruger de til at analysere afstanden mellem genloki og til at analysere genpolymorfismer.
1. Oversigt og nøgleforskel
2. Hvad er genetisk kort
3. Hvad er fysisk kort
4. Ligheder mellem genetisk kort og fysisk kort
5. Sammenligning side ved side - genetisk kort vs fysisk kort i tabelform
6. Resume
Et genetisk kort baserer sig på gen loci placeringer og genetiske markører identificeret ved bindingsanalyse og genassocieringsundersøgelser. Mendelian genetik forklarer de genetiske kort, og Gregor Mendel er den person, der introducerede dette koncept. Et genetisk kort er nyttigt til undersøgelse af kromosomplaceringer og gener involveret i at give anledning til særlige træk. Disse gener, der er arvet af dattergenerationerne, identificeres derefter som genetiske markører for en bestemt sygdom eller en karakter.
Figur 01: Genetisk kort
Flere avlsteknikker over mange generationer og derefter analysere avlsmønstre for en bestemt egenskab eller karakteristik er nødvendige, inden der konstrueres et genetisk kort. Og genforeningsundersøgelser understøtter desuden identifikationen af forskellige alleler, der er ansvarlige for specifikke arvemønstre i genetisk kortlægning. Allelfrekvenser og genfrekvenser hjælper med at forudsige genkortet for et bestemt gen på et kromosom.
Fysiske kort over gener konstruerer ved hjælp af molekylærbiologiske teknikker, såsom restriktionsenzymfordøjelse osv. Derfor, begrænsningskort er et andet navn på dette kort. Når der genereres et fysisk kort, i starten skærer restriktionsenzymer DNA'et i fragmenter. Disse fragmenter adskilles derefter ved gelelektroforese. Det næste trin er genereringen af det fysiske kort over DNA'et. Som et yderligere trin kan de underkastes blotting-teknikker efter hybridiseringen. På nuværende tidspunkt er teknikker med høj kapacitet såsom fluorescens in situ-hybridisering i brug til generering af fysiske kort til anvendelse som genetiske markører.
Figur 02: Fysisk kort
Fysiske kort er mere nøjagtige og hurtige sammenlignet med genetiske kort. Derfor er deres anvendelse til analyse af genpolymorfisme stor sammenlignet med genetiske kort. Fysisk kortlægning tager heller ikke hensyn til Mendelianske genetiske mønstre.
Genetisk kort er et genkort baseret på genkoblingen og genassocieringsundersøgelser udført på en genetisk markør eller genloki for et kromosom. Fysisk kort er et genkort, hvor genkortet er fysisk afledt ved at isolere DNA'et og opnå den nøjagtige genetiske markør ved anvendelse af molekylærbiologiteknikker. Med hensyn til de teknikker, der er anvendt i disse to kort, er forskellen mellem genetisk kort og fysisk kort, at det genetiske kort bruger genkoblings- og genassocieringsanalysemetoder, mens det fysiske kort bruger restriktionskortlægning og hybridiseringsteknikker. Derfor er nøjagtigheden i det genetiske kort lav, mens den er høj i det fysiske kort.
Når man sammenligner hurtigheden i de teknikker, der er brugt i disse to kort, har det genetiske kort mindre hurtige, tidskrævende teknikker. Imidlertid har det fysiske kort meget hurtige teknikker. Derfor er det genetiske kort mindre effektivt, mens det fysiske kort er meget effektivt. Endvidere er genetiske kort baseret på Mendelian arvemønstre, mens fysiske kort ikke direkte er på Mendelian arvemønstre.
Genstudier bruger genetiske markører placeret i kromosomerne. For at studere disse markører skal de kortlægges ved hjælp af forskellige teknikker. Mendelian genetik er grundlaget for genetiske kort. Under den genetiske kortlægning undersøges forskellige træk i mange generationer, og generene analyseres ved hjælp af genkoblings- og genassocieringsundersøgelser. I modsætning hertil involverer fysiske genkort kort isolering og karakterisering af genetiske markører fysisk ved at ekstrahere det. Dette er den største forskel mellem genetisk kort og fysisk kort.
1.O'Rourke, Jamie A. “Genetisk og fysisk kortkorrelation.” Encyclopedia of Life Sciences, nov. 2014. Tilgængelig her
2. "Faktaark om genetisk kortlægning." National Human Genome Research Institute (NHGRI). Tilgængelig her
1.'File: NHGRI Fact Sheet- Genetic Mapping (27058469495) 'Af National Human Genome Research Institute (NHGRI) fra Bethesda, MD, USA - NHGRI Fact Sheet: Genetic Mapping, (CC BY 2.0) via Commons Wikimedia
2.'Humankromosom Y - 400 550 850 bphs. Ved National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine (Public Domain) via Commons Wikimedia