Forskellen mellem Haplogroup og Haplotype

Det vigtigste forskel mellem haplogruppe og haplotype er det haplogruppe henviser til en gruppe lignende haplotyper, der deler en fælles stamfar, mens haplotype refererer til sæt alleler, der er arvet sammen fra generation til generation på grund af genetisk kobling.

Et gen består primært af to alleler. Der er tusinder af gener til stede i kromosomer. Når de adskiller sig, viser de crossovers og genetiske rekombinationer. Nogle alleler med gener er imidlertid placeret meget tæt på hinanden. Med enkle ord viser disse alleler en genetisk binding. Derfor er det ikke sandsynligt, at de vil krydse eller rekombinere. I stedet har de altid en tendens til at transmittere fra generation til generation. I overensstemmelse hermed er en haplotype en kombination af alleler eller et sæt enkeltnukleotidpolymorfismer, der er til stede på det samme kromosom, der arves sammen gennem generationer fra en enlig forælder. Haplogroup er en gruppe af lignende haplotyper, der deler en fælles stamfar.

INDHOLD

1. Oversigt og nøgleforskel
2. Hvad er Haplogroup 
3. Hvad er Haplotype
4. Ligheder mellem Haplogroup og Haplotype
5. Sammenligning side ved side - Haplogroup vs Haplotype i tabelform
6. Resume

Hvad er Haplogroup?

Haplogroup er en gruppe af lignende haplotyper, der deler en fælles stamfar. Med andre ord er en haplogruppe en kombination af alleler, der findes i forskellige kromosomer, der arves sammen. Disse alleler er meget tæt på hinanden. Haplotyperne i en haplogruppe har lignende mønstre og er beslægtede efterkommere, da de har en fælles stamfar. Det er således let at forudsige en haplogruppe ud fra haplotyper.

Figur 01: Haploggruppe

Der er to mest almindelige haplogrupper hos mennesker. Det er Y-kromosom-haplogrupper, der går fra far til søn, mens mitokondrielle DNA-haplogrupper, der går fra mor til datter eller søn.

Hvad er Haplotype?

En haplotype er et sæt alleler, der er arvet sammen. Disse alleler er til stede i det samme kromosom meget tæt på hinanden på grund af genetisk binding. Derfor er der ingen chance for rekombination eller crossovers. Derfor går de sammen fra generation til generation. Disse alleler kan være allelerne for et enkelt gen eller alleler på tværs af flere gener. En haplotype kan også henvise til en klynge af enkelt nukleotid-polymorfismer, der er til stede på det samme kromosom. Således er de et sæt DNA-variation eller polymorfisme arvet sammen.

Figur 02: Enkelt nukleotid-polymorfisme

Oplysninger om haplotyper er nyttige ved undersøgelse af genernes indflydelse på sygdomme. Ved at analysere haplotyper og haplotypetræer kan genetikere registrere de sygdomsrelaterede genomregioner og bestemme mønstre for genetisk variation relateret til sygdomme. Desuden er de nyttige under genkortlægning, når genetiske markører placeres de rigtige steder på kromosomerne.

Hvad er ligheden mellem Haplogroup og Haplotype?

  • Haploggruppe består af lignende haplotyper.
  • De viser genetiske bindinger.
  • Crossovers eller genetisk rekombination er fraværende i haplotyper og haplogrupper.

Hvad er forskellen mellem Haplogroup og Haplotype?

Haplogroup er en kombination af alleler, der er til stede i forskellige kromosomer, der arves sammen. Det består af lignende haplotyper, der deler en fælles forfader. En haplotype er på den anden side et sæt alleler, der findes i det samme kromosom, der arves sammen gennem generationer. Så dette er den vigtigste forskel mellem haplogruppe og haplotype.

Nedenstående infografisk opsummerer forskellen mellem haplogruppe og haplotype.

Resume - Haplogroup vs Haplotype

Haplogroup er en gruppe af lignende haplotyper, der deler en fælles stamfar. En haplotype er på den anden side en kombination af alleler eller et sæt enkeltnukleotid-polymorfismer, der er til stede på det samme kromosom, der føres gennem generationer fra en enlig forælder. Derfor er dette den vigtigste forskel mellem haplogruppe og haplotype. Haplotyper giver en nem måde at forudsige haplogrupper, da en haplogruppe består af lignende haplotyper.

Reference:

1. “Haplotype.” Genome.gov, tilgængelig her.
2. “Haplogroup.” Wikipedia, Wikimedia Foundation, 8. juli 2019, tilgængelig her.

Billede høflighed:

1. "Molekylær afstamning" Af Wobble - Eget arbejde (Public Domain) via Commons Wikimedia
2. “Dna-SNP” Af SNP-model af David Eccles (gringer) (CC BY 4.0) via Commons Wikimedia