Da avl og hybridisering er vigtige aspekter i beskyttelsen af arter, er det nyttigt at kende forskellen mellem hybridisering og indavl. Hybridisering og indavl er to forskellige typer af selektive avlsprocesser. Begge processer involverer planter og dyr med forskellige genetiske kvaliteter. De selektive avlsmetoder udføres normalt kunstigt for at producere specielle dyr og planter med specifikke træk såsom skadedyrbestandighed, kemisk tolerance, sygdomsresistens osv..
I genetik kaldes processen med at krydse genetisk forskellige individuelle forældre fra to arter for at producere et frugtbart afkom hybridisering. Den nye frugtbare afkom er kendt som en hybrid. Hybriderne er meget vigtige i processen med geografisk isolering og speciation. Hybridisering kan udføres eller forekomme i både planter og dyr. For eksempel er muldyr et meget almindeligt eksempel som et hybriddyr, der produceres gennem opdræt af et mandligt æsel og en hunhest. I dette eksempel har hest og æsel henholdsvis 64 og 62 kromosompar, men muldyr har kun 63. Hybriderne kan således have nye genkombinationer, som kan resultere i bedre tilpasning til visse miljøforhold, i modsætning til deres forældre. I sådanne tilfælde kan disse hybrider overleve som en ny art, hvilket styrker speciationen. Processen med plantehybridisering kan opdeles i flere kategorier, herunder inter-sorterende, intra-sorterende, inter-specifik og intergenerisk hybridisering.
Opdræt defineres som produktion af afkom ved parring af forældre, der er genetisk meget tæt beslægtede eller nære slægtninge. Indavl ændrer normalt ikke den samlede allelfrekvens. Imidlertid kan det øge mængden af homozygote genotyper, som i t urn øger forekomsten af sjældne recessive alleler. Indavl foretages normalt til dyr som køer, hunde, heste osv. For at videregive deres specifikke gener til de næste generationer. Der er imidlertid en mulighed for at videregive visse uønskede træk hos forældre til afkom, der kan forårsage genetiske lidelser.
• Hybridisering er processen med at krydse genetisk forskellige individer for at producere afkom, mens indavl er krydsningen af to nært beslægtede forældre (nære slægtninge), der deler meget ens alleler..
• Hybridisering resulterer i at der produceres afkom med meget forskellige alleler fra deres forældre, mens indavl producerer afkom med meget lignende allelmønstre som deres forældre.
• I hybridiseringen er to forskellige arter involveret, hvorimod forældrene hører til den samme art ved indavl.
• Hybridisering forbedrer de heterozygote alleler, mens indavl forøger mængden af homozygote alleler.
• Indavl involverer hele levende dyr, mens hybridisering involverer en del af dyr eller plante.
• Overførsel af visse uønskede træk fra forældre til afkom kan kontrolleres under hybridisering, men dette er umuligt ved indavl.
• Indavl er mere tilbøjelige til at forårsage genetiske abnormiteter, i modsætning til hybridisering.