Det vigtigste forskel mellem insertions- og erstatningsvektorer er, at insertionsvektoren har evnen til at indsætte moderate længder af fremmed DNA, mens erstatningsvektoren har evnen til at rumme større længder af fremmed DNA.
Fagvektorer er de bakteriofager, der anvendes til kloning. Der er to typer fagvektorer; de er indsættelsesvektor og erstatningsvektor. Alle fagvektorer består også af ikke-essentielle gener. Imidlertid skal disse gener fjernes fra fager for at lette nye fremmede DNA-insertioner.
1. Oversigt og nøgleforskel
2. Hvad er indsættelsesvektorer
3. Hvad er udskiftningsvektorer
4. Ligheder mellem indsættelses- og udskiftningsvektorer
5. Sammenligning side ved side - indsættelse vs udskiftningsvektorer i tabelform
6. Resume
Først og fremmest er indsættelsesvektor den enkleste form for lambda-kloningsvektorer. Faktisk er det en type fagvektor, der har et unikt restriktionssite introduceret i vektorgenomet i positionen som valgfrit DNA. Desuden forbliver fag-DNA'et uden fjernelse. Denne ikke-fjernelse af fag-DNA'et begrænser størrelsen af indsatserne (fremmed DNA), der skal klones inden i vektoren. Desuden er disse vektorer nyttige til cDNA-kloning og ekspression. GT10, GT11 og Zap er eksempler på denne vektor.
Figur 01: Lambda Phage
Indsætningsvektor består af et enkelt genkendelsessted. Den primære funktion af denne vektor er at udvikle cDNA-biblioteker afledt af eukaryote mRNA-sekvenser. Desuden kan det kun rumme længder af fremmed DNA i intervallet mellem 05-11 kb. Desuden besidder det et unikt spaltningssted til indsættelse af fremmed DNA.
Erstatningsvektor eller substitutionsvektor er en type fagvektor udviklet fra fjernelse af et midterste 'fyldstoffragment' område af fag-DNA. Det ønskede fremmede DNA-insert erstatter fag-DNA'et.
Figur 02: Udskiftningsvektor
Erstatningsvektorer er vigtige for at skabe genomiske biblioteker såsom EMBL4 og Charon40. Disse vektorer kan rumme en større længde af fremmed DNA, der spænder mellem 08-24 kb længder. Fyldstofområdet består også af et gen, der gør fagvektoren ikke levedygtig i en bakteriel vært.
Indsættelse vs udskiftningsvektorer | |
Indsætningsvektor er en type fagvektor, der har et restriktionssite introduceret i faggenomet på stedet for valgfrit DNA. | Erstatningsvektor er en type fagvektor udviklet fra fjernelse af et midterste 'fylderfragment' område af fag-DNA |
Størrelse på indsættelsesfragmenter | |
05-11 kb længde | 08-24 kb længde |
Påfyldningsfragment | |
Intet fyldstoffragment | Fillerfragment erstattes af en fremmed indsats |
Fungere | |
Vigtigt at oprette cDNA-biblioteker | Vigtigt i oprettelse af genombiblioteker |
eksempler | |
GT10, GT11 og Zap er eksempler | EMBL4 og Charon40 er eksempler |
Spaltningsside | |
Et unikt spaltningssted er til stede | Spaltningssted indeholder gener, der ikke er essentielle for den lytiske cyklus |
Både insertions- og erstatningsvektorer er to typer fagvektorer. Begge vektorer har restriktionssteder, der letter indkvartering af nye udenlandske DNA-indsatser. Indsætningsvektorer er vigtige for at skabe cDNA-biblioteker, mens erstatningsvektorer er vigtige for at skabe genomiske biblioteker. Yderligere sætter insertionsvektorer DNA-insertioner med en moderat længde. Men erstatningsvektorer kan rumme større længder af fremmede DNA-indsatser. Samlet set er dette nøgleforskellen mellem indsættelses- og udskiftningsvektorer.
1. Hasty, P, et al. "Effektivitet af indsættelse versus udskiftning af vektormålretning på forskellige steder varierer på forskellige kromosomale steder." Molecular and Cellular Biology, U.S. National Library of Medicine, december 1994, tilgængelig her.
2. "Lambda-indsættelsesvektorer." Biologi 335 Foredragsnotater - Lambda-vektorer, tilgængelig her.
3. "Erstatningsvektor." Erstatningsvektor - Terminologi for molekylærbiologi til udskiftningsvektor - GenScript, tilgængelig her.
1. “Lambda phage” Af Lizanne Koch - eget arbejde med ChemBioDraw (Public Domain) via Commons Wikimedia