Det vigtigste forskel mellem motiv og domæne er, at motiv er ikke uafhængigt stabilt, mens domænet er uafhængigt stabilt.
Proteiner er vigtige biologiske makromolekyler, der findes i vores krop. På den anden side bestemmer et genetes genetiske kode aminosyresekvensen for et protein. Derudover har proteiner primære, sekundære og tertiære strukturer. Den primære struktur er aminosyresekvensen i polypeptidkæden. Når polypeptidkæder foldes sammen, danner det proteinets sekundære struktur. Alfa-helikser, beta-ark og supersekundære strukturer hører til de sekundære strukturer. Visse grupper af supersekundære elementer er kendt som proteinmotiver. Proteinets tertiære struktur refererer til dets tredimensionelle struktur, der bestemmer proteinets funktion. Domæne er et foldet afsnit af et proteinmolekyle, som er kugleformet og har en diskret funktion. Det er den grundlæggende funktionelle og tredimensionelle struktur af proteinet.
1. Oversigt og nøgleforskel
2. Hvad er motiv
3. Hvad er domæne
4. Ligheder mellem motiv og domæne
5. Sammenligning side ved side - Motiv vs domæne i tabelform
6. Resume
Motiv er en bestemt gruppering af supersekundære elementer i proteiner såsom alfa-helikser og beta-strukturer. De er en slags mønstre, der findes i forskellige proteiner. Motiver beskriver foldemønstrene for de sekundære strukturelle elementer og deres interaktion. Disse foldemønstre stabiliseres ved lignende forbindelser, der er til stede i tertiære strukturer. De er imidlertid ikke så komplekse som tertiære strukturer.
Figur 01: Motiv
De er enkle kombinationer af sekundære strukturer af proteiner. Motivet er ikke af sig selv stabilt. Yderligere forklarer motiver strukturen af et protein, men forudsiger ikke proteinets funktion. Eksempler på proteinmotiver er et beta-alpha-beta-motiv, græsk nøglemotiv, Beta-tønde, Beta-meander-motiv osv..
Domæne er en grundlæggende, funktionel og tredimensionel enhed af et protein. Den udfører en bestemt funktion. Et enkelt protein kan have flere forskellige domæner. Hvert domæne er en uafhængig enhed. Det er en kugleformet struktur. Det er ansvarlig for en bestemt funktion eller interaktion. Domæner kan bruges til hypotese om funktionen af et ikke-karakteriseret protein. Ved analyse af et protein er det vigtigt at tage hensyn til, da domæner er proteinets funktionelle enheder.
Figur 02: Tre forskellige domæner af Pyruvat-kinase
Domæner er meget stabile og kompakte strukturer. De kan let adskilles fra andre regioner. Pyruvatkinase har tre forskellige domæner som vist i figur 02. Længden af domænet kan variere, og den gennemsnitlige længde er 100 aminosyrer. Hvert domæne indeholder en hydrofob kerne bygget af sekundære strukturelle enheder. Flere domæner udgør samlet et tertiær struktur for et protein.
Motiv er en bestemt gruppering af supersekundære elementer i proteiner, såsom alfa-helikser og beta-strukturer, mens domæne er den funktionelle enhed for et protein. Yderligere er motiv en sekundær struktur, mens domæne er ansvarlig for proteinets tertiære struktur. Desuden er domæne en uafhængig enhed, i modsætning til et motiv. Domæne afbilder også proteinets funktion, mens motiv ikke er det. Dette er de vigtigste forskelle mellem motiv og domæne. Nedenstående infografik viser forskellen mellem motiv og domæne i tabelform.
Motiv er et arrangement af sekundære strukturer i proteinmolekylet. Det er normalt ikke i sig selv i modsætning til et domæne. Domæne er en uafhængigt stabil struktur af et protein. Derfor kan det være en del eller hele proteinmolekyle. Det er en tredimensionel grundlæggende funktionel enhed af proteinet. Desuden har det en funktion, og det er en uafhængig enhed. Motiv kan være en del af domænet. Men domæne kan ikke være en del af et motiv. Dette er forskellen mellem motiv og domæne.
1. "Proteindomæne." Wikipedia, Wikimedia Foundation, 31. juli 2018. Tilgængelig her
1. ”Anthrax toxin protein key motiv” Af NatelewisDerivative work (CC BY-SA 3.0) via Commons Wikimedia
2. ”Pyruvat kinase protein domains” Af Thomas Splettstoesser - Eget arbejde, (CC BY-SA 3.0) via Commons Wikimedia