Forskel mellem Plasmid og Cosmid
Share
Det vigtigste forskel mellem plasmid og kosmid er det plasmidet er et dobbeltstrenget, cirkulært og lukket ekstra-kromosomalt DNA til stede i bakterier og archaea, mens kosmidet er et hybridvektorsystem dannet på grund af kombination af cos sekvens af lambda-fag og plasmid-DNA fra bakterier.
Genetik er en avanceret undersøgelse under bioteknologi. Genteknologi kan ændre eller ændre genomet i levende organismer. Endvidere er genteknologi nyttigt i genterapi og behandling af genetiske lidelser. Før indsættelse af gener i en anden organisms genom er det nødvendigt at fremstille et rekombinant DNA-molekyle, der kan bære det ønskede DNA-fragment og levere til værtsorganismen. Under den rekombinante DNA-teknologi udføres det derfor af et vektorsystem. Derfor fungerer en vektor som et køretøj eller en mægler mellem donor og værtsorganisme. Plasmid og kosmid er to typer vektorer, der almindeligvis anvendes til rekombinant DNA-teknologi og genteknologi. Nogle er naturlige vektorer, mens andre er kunstige vektorer. Plasmidet er en naturlig vektor, medens kosmid er en kunstigt konstrueret vektor. Begge typer har fordele og ulemper.
INDHOLD
1. Oversigt og nøgleforskel
2. Hvad er Plasmid
3. Hvad er Cosmid
4. Ligheder mellem Plasmid og Cosmid
5. Sammenligning side ved side - Plasmid vs Cosmid i tabelform
6. Resume
Hvad er Plasmid?
Plasmidet er et lille, cirkulært, dobbeltstrenget DNA, der er til stede i prokaryotiske organismer hovedsageligt i bakterier og archaea. De findes som lukkede cirkler inde i bakterien. Plasmider er heller ikke genomisk DNA. Derfor påvirker tilstedeværelsen eller fraværet af plasmider i prokaryote celler ikke overlevelsen af disse celler. Plasmider er ekstrakromosomalt DNA. Imidlertid tilvejebringer plasmider yderligere fordele for bakterier og archaea. De indeholder specielle gener såsom antibiotikaresistens, resistens mod forskellige tungmetaller, nedbrydning af makromolekyle osv.
Desuden er plasmider i stand til selvreplikation uden at binde til kromosomerne. Det bærer gener eller de oplysninger, der er nødvendige for dens egen replikation og vedligeholdelse. Desuden er de uafhængigt DNA. På grund af disse særlige træk har plasmider enorm anvendelse i molekylærbiologi som vektorer.
Figur 01: Plasmider
Den dobbeltstrengede natur af DNA'et, antibiotiske resistensgener, selvreplikerende evne og specielle restriktionssteder er de vigtige egenskaber, der gør plasmider mere egnede som vektormolekyler i rekombinant DNA-teknologi. Og også plasmider er lette at isolere og omdanne til værtsbakterier.
Hvad er Cosmid?
Cosmid er et hybridvektorsystem. Det er en kunstig vektor konstrueret ved at kombinere cos sekvenser af Lambda-fagpartikler og et plasmid. Disse cos steder eller sekvenser er lange DNA-fragmenter, der omfatter 200 basepar. De har sammenhængende eller klæbrige ender, der tillader plasmidet at passe ind i det virale DNA. Derfor er cos-stederne afgørende for emballering af DNA. Der er tre cos-steder, nemlig cosN-sted, cosB-sted og cosQ-sted. Disse steder involverer i nicking af DNA-strengen ved terminaseaktivitet, ved at holde terminasen og i at forhindre nedbrydning af DNA'et med henholdsvis DNaser.
Figur 02: Cosmid
Kosmider kan enten replikere enkeltstrenget DNA eller dobbeltstrenget DNA under anvendelse af et passende replikationsorigin. De indeholder også antibiotiske resistensgener, der kan være nyttige som markører til valg af transformerede celler. I lighed med plasmider er kosmider også gode vektorer inden for rekombinant DNA-teknologi.
Hvad er ligheden mellem Plasmid og Cosmid?
- Plasmid og cosmid er vektorer, der almindeligvis anvendes i rekombinant DNA-teknologi.
- Begge er i stand til selvreplikation.
- De har oprindelsen af replikation.
- Desuden besidder de flere kloningssteder.
- De indeholder også antibiotikaresistente gener, der er nyttige som markører.
- Fremmed DNA kan indsættes i begge typer og fremstille rekombinante molekyler.
- Nem screeningsmetoder er tilgængelige for begge vektorer.
- Begge er nyttige til at konstruere genomiske biblioteker.
Hvad er forskellen mellem Plasmid og Cosmid?
Plasmid og kosmid er to typer kloningsvektorer anvendt i genteknologi. Plasmider er små, cirkulære dobbeltstrengede ekstrakromosomale DNA-molekyler til stede i bakterier og archaea. På den anden side er cosmid en hybridvektor konstrueret ud fra cos-sekvenser af lambda-fag-DNA og plasmid-DNA. Dette er den vigtigste forskel mellem plasmid og kosmid. Desuden kan plasmider bære op til 25 kb DNA-fragmenter, mens comsids er i stand til at indeholde op til 45 kb fragmenter. Dette er således en anden forskel mellem plasmid og kosmid.
Flere detaljer er angivet i infografien af forskellen mellem plasmid og kosmid.
Resume - Plasmid vs Cosmid
Plasmidet er et naturligt forekommende ekstrakromosomalt DNA, mens kosmid er en hybridvektor af fag-DNA og plasmid-DNA. Begge er kloningsvektorer anvendt i rekombinant DNA-teknologi. Kosmider indeholder specielle klæbrige ender kendt som cos-steder, der kræves til in vitro emballage. På den anden side indeholder plasmider flere funktioner, der gør dem til ideelle vektorer inden for genteknologi. Begge kan gennemgå uafhængig replikering eller in vitro emballering til bakterieceller. Plasmider er i stand til at indeholde et fremmed DNA-fragment med en længde på 25 kb, mens kosmider er i stand til at indeholde et fremmed DNA-fragment på 45 kb. Kosmider er derfor nyttige i kloningsformål til kloning af større fragmenter af DNA, da plasmidvektorer ikke kan klone større fragmenter. Dette opsummerer således forskellen mellem plasmid og kosmid.
Reference:
1.Nature News, Nature Publishing Group. Tilgængelig her
2. ”cosmid.” NeuroImage, Academic Press. Tilgængelig her
Billede høflighed:
1. ”Plasmid (engelsk)” Af Spaully - Eget arbejde, (CC BY-SA 2.5) via Commons Wikimedia
2. ”Cosmid (engelsk)” Af Zlir'a (CC0) via Commons Wikimedia
