Forskel mellem Proteomik og Metabolomik

Det vigtigste forskel mellem proteomics og metabolomics er det proteomics er studiet af alle proteiner i en organisme, mens metabolomics er studiet af alle metabolitter i en organisme.

Genomics er studiet af den organiske sammensætning af en organisme. Proteomik og metabolomik er to omiske videnskaber relateret til genomik. Proteom refererer til alle proteiner i en celle eller en organisme. Metabolom, derimod, henviser til alle metabolitter i en organisme. Undersøgelsen af ​​proteomet er således proteomikken, mens studiet af metabolomet er metabolomikken. Både proteomics og metabolomics er vigtige i sygdomsdiagnostik og i karakterisering og screening af organismer. Derudover er begge forbindelser forbundet med mange aspekter af cellebiologi, især inden for cellesignalering, proteindedbrydning og generering og post-translationel modifikation.

INDHOLD

1. Oversigt og nøgleforskel
2. Hvad er Proteomics
3. Hvad er metabolomics
4. Ligheder mellem protein og metabolomik
5. Sammenligning side ved side - Proteomik kontra metabolomik i tabelform
6. Resume

Hvad er Proteomics?

Proteom er det totale proteinkomplement i en celle, væv eller en organisme. Derfor er proteomik studiet af proteomet i en organisme. I proteomik analyseres forskellige egenskaber ved proteiner. Derfor fokuserer proteomics hovedsageligt på struktur, orientering, funktioner, proteininteraktioner, modifikationer, applikationer og vigtigheden af ​​proteiner. Derfor gennemføres mange forskningsprojekter inden for området proteomik i øjeblikket.

De første proteomiske undersøgelser blev udført for at identificere proteinindholdet i Escherichia coli. Kortlægningen af ​​det totale proteinindhold blev udført under anvendelse af to-dimensionelle (2D) geler. Efter succes med dette projekt gik videnskabsmænd videre med at karakterisere det samlede proteinindhold i dyr som marsvin og mus. På nuværende tidspunkt foretages kortlægning af human protein under anvendelse af 2D-gelelektroforese.

Der er mange fordele ved at studere proteomik, da proteiner er de styrende molekyler af mest aktivitet på grund af proteinernes katalysatoregenskaber. Undersøgelsen af ​​hele proteiner kan således give information om en organisms sundhedsstatus. Derudover har proteomics mange anvendelser inden for genomannotering, sygdomsidentifikation og diagnostik, udførelse af proteinekspressionsundersøgelser under eksperimentering og proteinmodifikationer og interaktionsstudier osv.

Figur 01: Proteomics

Der er forskellige teknikker involveret i proteomik, herunder ekstraktion af det totale protein, adskillelse af dem ved anvendelse af 2D gelelektroforese, sekventering af de ekstraherede proteiner ved anvendelse af metoder såsom Edmunds sekventeringsmetode eller massespektrometri og analyse af proteinets strukturelle og funktionelle egenskaber ved anvendelse af computerbaseret software og bioinformatikværktøjer.

Hvad er Metabolomics?

Metabolomics er studiet af alle metabolitter i en celle, væv eller en organisme. Det inkluderer identifikation og kvantificering af cellulære metabolitter ved hjælp af forskellige avancerede analytiske og statistiske værktøjer. Metabolomics er en vigtig undersøgelse, da den afslører oplysninger om metabolismens organisme.

Figur 02: Metabolomics

For at undersøge underlag og produkter af metaboliske reaktioner bruger metabolomics massespektrometri som en analytisk platform. Massespektrometri resulterer i metabolitter og deres koncentrationer, hvilket afspejler den faktiske biokemiske tilstand af cellerne eller vævene. Derfor kan metabolomics betragtes som den bedste repræsentation af den molekylære fænotype af en organisme. Ud over disse kan metabolomics betragtes som en forlængelse af proteomics, fordi de fleste metabolitter genereres på grund af aktiviteterne af enzymer, der er proteiner.

Hvad er ligheden mellem protein og metabolomik?

• Proteomik og metabolomik er to omiske videnskaber relateret til genomik.
• Metabolomics kan betragtes som en udvidelse af proteomics.
• Proteom og stofskifte er tæt sammenflettet med mange undersøgelser.

Hvad er forskellen mellem Proteomik og Metabolomik?

Proteomics er en storstilet undersøgelse af proteiner inklusive deres struktur og funktion i en celle eller en organisme. I mellemtiden er metabolomics studiet af metabolitprofiler i en celle, væv eller organisme under et givet sæt betingelser. Så dette er den vigtigste forskel mellem proteomics og metabolomics. Derudover angår proteomics hovedsageligt det komplette sæt proteiner, mens metabolomics hovedsageligt vedrører det komplette sæt metabolitter, herunder en forskelligartet række små molekyler, såsom peptider, kulhydrater, lipider, nucleosider og katabolske produkter af eksogene forbindelser osv. Derfor er dette en anden forskel mellem proteomics og metabolomics.

Nedenstående infografik opsummerer forskellen mellem proteomics og metabolomics.

Resume - Proteomics vs Metabolomics

Levende organismer kan studeres ved hjælp af deres genom, proteiner og metabolitter. Genomik, proteomik og metabolomik er de tre områder, der studerer henholdsvis genetisk sammensætning, proteiner og metabolitter i en celle eller en organisme. Proteomik er vigtig, da det er en dynamisk refleksion af både gener og miljøet. Metabolomik er meget vigtig, da det direkte afspejler den aktuelle status for den biokemiske reaktion af cellerne eller metabolismens status for en organisme. Dette opsummerer således forskellen mellem proteomics og metabolomics.

Reference:

1. P, Surat. “Hvordan er metabolomet og proteinet relateret?” Nyheder, 26. februar 2019, tilgængelig her.
2. Horgan, Richard P og Louise C Kenny. “Omic” -teknologier fra SAC: Genomics, Transcriptomics, Proteomics and Metabolomics. ” Obstetrics and Gynecology, John Wiley & Sons, Ltd (10.1111), 18. juli 2011, tilgængelig her.

Billede høflighed:

1. “Proteomics” af Xxl7441 på engelske Wikibooks - Overført fra en.wikibooks til Commons. (Public Domain) via Commons Wikimedia
2. "Metabolomics-skema" Af Lmaps (tale) - Jeg oprettede dette værk udelukkende af mig selv (CC BY-SA 3.0) via Commons Wikimedia