Forskel mellem Rho-afhængig og Rho-uafhængig opsigelse

Det vigtigste forskel mellem Rho-afhængig og Rho-uafhængig opsigelse er den i Rho-afhængig terminering, Rho-faktor binder til transkriptet og afslutter transkription ved at bryde brintbindinger mellem skabelonen og transkriptet, mens Rho-uafhængig terminering afslutter transkriptionen ved at producere en hårnålsløjtestruktur og derefter U-rig region i transkriptet.

Transkription er et af de to stadier i genekspression. Det er processen, der producerer en mRNA-sekvens fra den genetiske information, der er skjult i DNA-sekvensen af ​​genet. Transkription foregår via tre trin: initiering, forlængelse og afslutning. RNA-polymeraseenzym binder til promotorsekvensen af ​​genet og begynder at katalysere syntesen af ​​RNA-strengen. Indtil terminatorsekvensen findes, tilføjer RNA-polymerase nucleotider og bygger RNA-strengen. I prokaryoter sker terminering gennem to vigtige afslutningsstrategier: Rho-afhængig afslutning og Rho-uafhængig afslutning. Rho-faktor er et protein, der har helikaseaktivitet.

INDHOLD

1. Oversigt og nøgleforskel
2. Hvad er Rho afhængig afslutning
3. Hvad er Rho-uafhængig opsigelse
4. Ligheder mellem Rho-afhængig og Rho-uafhængig opsigelse
5. Sammenligning side ved side - Rho afhængig vs Rho uafhængig afslutning i tabelform
6. Resume

Hvad er Rho afhængig afslutning?

Rho-afhængig terminering er en af ​​de to typer transkriptionstermineringsstrategi, der forekommer i prokaryoter. Rho-faktor er et protein, der har helikaseaktivitet.

Figur 01: Rho afhængig afslutning

Rho-protein binder til RNA-transkriptet og bevæger sig langs RNA-polymerasen i 5'-3'-retning, hvilket tilskynder til dissociation af hydrogenbindinger mellem DNA-skabelonen og RNA-transkriptet. Når Rho-faktor når transkriptionsboblen, trækkes den DNA / RNA-hybrid fra hinanden og frigiver transkriptet fra transkriptionsboblen. Når dette sker, afslutter det transkriptionen.

Hvad er Rho uafhængig opsigelse?

Rho uafhængig afslutning er den anden strategi, der afslutter prokaryot transkription. Normalt har en terminatorregion en omvendt gentagelsessekvens. Umiddelbart efter den inverterede gentagelsessekvens er der en Adenin-rig region (AAAA). Når RNA-polymerase bevæger sig foran, producerer den en mRNA-sekvens. Da de to regioner er komplementære i det inverterede gentagelsessekvensområde, danner det en hårnålslynge-struktur på grund af hydrogenbinding. Næste region er den U-rige region. Hårnålsstruktur ophører med RNA-polymeraseaktiviteten.

Figur 02: Rho uafhængig afslutning

Derudover er der i U-rige regioner svage interaktioner mellem U-baser for transkription og A-baser i skabelonen. Disse svage Adenine-Uracil-bindinger destabiliserer DNA-skabelonen og RNA-transkriptionen og adskiller hinanden. I sidste ende frigøres transkription fra transkriptionsstedet.

Hvad er ligheden mellem Rho-afhængig og Rho-uafhængig opsigelse?

• Rho-afhængig og Rho-uafhængig afslutning er to vigtige afslutningsstrategier, der findes i prokaryoter.
• Begge former frigiver transkription fra DNA-skabelonen for at afslutte transkriptionen.

Hvad er forskellen mellem Rho-afhængig og Rho-uafhængig opsigelse?

Rho-afhængig terminering medieres af et Rho-protein, medens Rho-uafhængig terminering sker via dannelsen af ​​en hårnålslynge-struktur. Så dette er den vigtigste forskel mellem Rho-afhængig og Rho-uafhængig afslutning. Desuden bruger Rho-protein ATP-energi, mens Rho-uafhængig terminering ikke involverer Rho-protein og ikke bruger ATP-energi. Derfor er dette også en betydelig forskel mellem Rho-afhængig og Rho-uafhængig afslutning.

Nedenstående infografisk viser flere sammenligninger relateret til forskellen mellem Rho-afhængig og Rho-uafhængig afslutning.

Resume - Rho Dependent vs Rho Independent Termination

Rho-afhængig og Rho-uafhængig terminering er de to vigtigste transkriptionstermineringsmekanismer, der forekommer i prokaryoter. Et Rho-protein er ansvarligt for transkriptionstermineringen ved Rho-afhængig terminering. I modsætning hertil forekommer uafhængig Rho-terminering via en dannelse af hårnålsløjtestrukturen. Så dette er den vigtigste forskel mellem Rho-afhængig og Rho-uafhængig afslutning.

Reference:

1. "Trin af transkription." Khan Academy, tilgængeligt her.
2. "Intrinsic Termination." Wikipedia, Wikimedia Foundation, 8. februar 2019, tilgængelig her.

Billede høflighed:

1. “Rho -afhængig terminator” af Oalnafo1 - Eget arbejde (CC BY-SA 3.0) via Commons Wikimedia
2. "Rho-uafhængig terminator" Af Ppgardne på engelsk Wikipedia (CC BY-SA 3.0) via Commons Wikimedia