Forskel mellem rodet og urørt filogenetisk træ

Nøgleforskel - rodet vs urørt filogenetisk træ
 

Filogeni er et vigtigt felt, der udforsker livet på jorden gennem tiden. Det afslører forbindelsen mellem organismer med deres forfædre og efterkommere. Forholdene mellem organismer er skematisk repræsenteret af forskellige trælignende repræsentationer, såsom dendogram, cladogram, fenogram, phylogram, osv. Et fylogenetisk træ er et forgrenende trælignende diagram, der forklarer de fylogenetiske forhold mellem organismer med mængden af ​​evolutionær afstand. Der er to hovedtyper af fylogenetiske træer, der er kendt som rodfæstede og ubehandlede. Den vigtigste forskel mellem det rodfæstede og ubehandlede fylogenetiske træ er det rodfæstet træ viser træets mest basale stamfar mens urodede fylogenetisk træ viser ikke en stamfæst.

INDHOLD
1. Oversigt og nøgleforskel
2. Hvad er et rodet, fylogenetisk træ
3. Hvad er et urørt filogenetisk træ
4. Sammenligning side ved side - rodet vs urørt filogenetisk træ
5. Resume

Hvad er et rodet phylogenetic træ?

Et rodfæstet fylogenetisk træ fungerer som et nyttigt diagram, der viser udviklingshistorien. Den har en basalknude, der kaldes roden, der repræsenterer den fælles stamfar til alle træets grupper. Roden af ​​et træ betragtes som det ældste punkt i træet, der repræsenterer den sidste fælles stamfar til alle grupper inkluderet i træet. Derfor viser et rodfæstet træ retningen på evolutionær tid. Fra en enkelt art af et rodfæstet træ kan den almindelige aner eller arten stamfader findes ved at spore tilbage til basalknuden. Da det rodfæstede træ viser retningen for evolutionær tid, er det let at finde de ældre eller nyere grupper, det har. Et rodfæstet træ kan bruges til at studere hele organismer. Nøjagtig rodfæstelse af et fylogenetisk træ er en vigtig og afgørende faktor, da unøjagtig rodfæstelse kan resultere i forkerte fortolkninger af genetiske ændringer mellem organismer og deres retningsevne i udviklingen..

Figur 01: Et rodet phylogenetic træ

Hvad er et urettet filogenetisk træ?

Et uprotet fylogenetisk træ er et fylogenetisk diagram, der mangler en fælles stamfar eller en basalknude. Denne type træ angiver ikke oprindelsesudviklingen for interessegrupperne. Det skildrer kun forholdet mellem organismer uanset retningen på den evolutionære tidslinje. Derfor er det vanskeligt at undersøge gruppernes evolutionsforhold med hensyn til tid ved hjælp af et ubehandlet træ.

Der er to hovedmåder til at rodfæste et urettet filogenetisk træ. De er

• Find en outgroup - Dette kræver forudgående viden om forholdet mellem taxa. Derefter kan et taxon, der ligger uden for gruppen, bruges som en outgroup til at tegne et rodfæstet fylogenetisk træ

• Find midtpunktet eller afstanden - Midepunktet for de fjerneste to taxaer i træet kan antages at være en rod til det fylogenetiske træ.

Figur 02: Et urørt filogenetisk træ

Hvad er forskellen mellem rodet og urørt filogenetisk træ?

Rotet vs urørt filogenetisk træ
Et rodfæstet fylogenetisk træ er et diagram, der viser den sidste fælles stamfar til grupperne.	Et uprotet fylogenetisk træ viser forholdet mellem organismer uden at vise den fælles stamfar.
Node
Det har en knude (rod).	Den har ikke en knude.
Evolutionens retning
Det har en retning, der angiver den evolutionære tid.	Det specificerer ikke et evolutionært forhold.
Holdning til andre
Træet gør det muligt at bestemme forholdet mellem forfædre og efterkommer mellem grupper.	Træet tillader ikke at tale om forhold mellem forfader og efterkommer.

Sammendrag - Rooting vs Unrooted Phylogenetic Tree

Et fylogenetisk træ repræsenterer de evolutionære veje og forbindelser mellem organismer ved hjælp af forgrenede trælignende diagrammer. Den fylogenetiske lokk kan være rodfæstet eller ubehandlet. Et rodfæstet træ har en knude ved basen, der repræsenterer den fælles stamfar, der forbinder alle interessegrupper. Et uret træ viser forholdet mellem organismer. Det skildrer imidlertid ikke den fælles stamfar, som alle grupperne deler. Dette er forskellen mellem rodfæstet og ubehandlet fylogenetisk træ.

Referencer:
1. "Træ" -fakta: rodet versus urørte træer. " National Center for Biotechnology Information. U.S. National Library of Medicine, n.d. Web. 4. april 2017
2. Graham, Sean W., Richard G. Olmstead og Spencer C. H. Barrett. ”Rooting af fylogenetiske træer med fjerne outgroups: En casestudie fra de Commelinoid monocots.” Molekylærbiologi og -evolution. Oxford University Press, 1. oktober 2002. Web. 4. april 2017