siRNA vs miRNA
RNA'er er meget vigtige molekyler, som hjælper med at opbygge organismenes liv. For nylig har forskere opdaget små opkaldte RNA'er RNA-interferens eller RNAi, der virker efter transkriptionen for at kontrollere genekspression. De to hovedtyper af små RNA'er er mikro RNA eller miRNA og lille interfererende RNA eller siRNA. Disse molekyler regulerer grundlæggende genekspressionen ved at undertrykke målgenet. Både miRNA og siRNA har meget lignende biogeneseveje, selvom der er nogle forskelle mellem dem. Oprindelsen af miRNA og siRNA er fra dsRNA-molekyler. Ældre miRNA'er er strukturelt ligner siRNA-molekyler.
miRNA
Mikro-RNA'er eller miRNA'er er de små RNA-molekyler, som medierer den sidste kontrol i translationel genregulering. Deregulering af miRNA kan føre til kræft og anden sygdomsudvikling. Derfor er korrekt regulering af information kodet i den ikke-kodende region af miRNA meget kritisk i mange grundlæggende cellulære processer.
siRNA
siRNA'er kaldes også kort interfererende eller lydløs RNA og er sammensat af dobbeltstrenget RNA med 20 til 25 basepar. SiRNAs vigtigste rolle er at interferere med ekspressionen af specifikke gener med komplementære nukleotidsekvenser. siRNA består af kort dobbeltstrenget RNA med phosphorylerede 5'-ender og hydroxylerede 3'ender med to overhængende nukleotider.
Hvad er forskellen mellem siRNA og miRNA?
• miRNA afledt fra specifikke genomiske loci, mens siRNA er afledt af mRNA, transposoner, vira eller heterochromatisk DNA.
• Syntese af miRNA behandles fra længere forløberhårnåle-transkripter (primær nuklear miRNA-sekvens ved RNase III endonuclease), hvorimod den for siRNA, der er behandlet ud fra lange bimolekylære RNA-duplexer.
• Hvert miRNA-hårnåleforløbermolekyle producerer enkelt miRNA-duplex, mens hvert siRNA-forløbermolekyle producerer flere siRNA-duplexer.
• siRNA-sekvenser konserveres sjældent, mens miRNA-sekvenser er godt konserverede.
• Alle baser inden for siRNA bidrager til dens målspecificitet, mens kun 5 'halvdelen af miRNA bidrager til dens målspecificitet.
• miRNA binder ofte til den 3 'utranslaterede region af måltranskripter, mens siRNA'er danner komplementær duplex hvor som helst langs et mål-mRNA.
• miRNA specificerer 'hetero-lyddæmpning', mens siRNA bruges til 'auto-lyddæmpning'.
• miRNA fungerer som et signal for at forhindre oversættelse, mens siRNA fysisk forhindrer oversættelse.