DNA-polymerase er et enzym, der skaber nyt DNA fra dets byggesten (nucleotider). I prokaryoter og eukaryoter findes forskellige typer DNA-polymeraser. DNA-duplikering er mulig på grund af tilstedeværelsen af disse specielle enzymer, og genetisk information overføres til afkom ved hjælp af DNA-polymeraser. Taq-polymerase er en speciel type DNA-polymerase, som er termostabil og er vidt brugt i PCR. Taq-polymerase findes i termofile bakterier og renses i in vitro DNA-replikation. Det vigtigste forskel mellem Taq-polymerase og DNA-polymerase er det Taq-polymerase kan modstå høje temperaturer uden denaturering, mens andre DNA-polymeraser denaturerer ved høje temperaturer (ved proteinnedbrydende temperaturer).
INDHOLD
1. Oversigt og nøgleforskel
2. Hvad er Taq Polymerase
3. Hvad er DNA-polymerase
4. Sammenligning side ved side - Taq Polymerase vs DNA Polymerase
5. Resume
Taq-polymerase (Taq DNA-polymerase) er et enzym anvendt til syntese af DNA in vitro ved hjælp af PCR-teknik. Det er produceret af den kaldte termofile bakterie Thermus aquaticus der bor i varme kilder og termiske ventilationsåbninger. Taq-polymerase er et termostabilt enzym, som ikke nedbrydes ved høje temperaturer. Taq-polymerase blev oprenset for første gang og offentliggjort i Chien et al. i 1976. PCR-teknik udføres ved hjælp af Taq-polymerase på grund af dens evne til at tolerere høje temperatur- og temperatursvingninger under PCR. Taq-polymerase katalyserer DNA-syntesen, når der er primere, nukleotider og det enkeltstrengede skabelon-DNA. Enzymet består af et enkelt polypeptid med en molekylvægt på ca. 94 kDa. Taq-polymerase viser sin optimale aktivitet ved 80 ° C og ved 7 - 8 pH-område med tilstedeværelse af magnesiumioner. Det har både polymerase og exonuclease-aktivitet. Enzymet er sammensat af en enkelt polypeptidkæde, og genet for Taq-polymerase indeholder højt G- og C-indhold (67,9%).
Termostabil Taq-polymerase tillader udførelse af PCR ved høje temperaturer, der øger primerens specificitet og reduktion af produktion af uønskede PCR-produkter (primerdimerer). Taq-polymerase eliminerer også behovet for at tilføje nye enzymer til PCR-reaktionen efter hver eneste PCR-reaktionscyklus på grund af dens evne til at modstå høje temperaturer. Opdagelsen af Taq-polymerase gjorde PCR i stand til at udføre i et enkelt lukket rør i en relativt simpel maskine. På grund af disse egenskaber ved Taq-polymerase bliver PCR en populær rutinemæssigt udført laboratorieteknologi i mange molekylærbiologiske analyser vedrørende DNA-analyse.
Taq-polymerase er vidt brugt i molekylærbiologiske teknikker, og der er behov for storstilet Taq-polymerase-produktion. Ved anvendelse af den rekombinante DNA-teknologi og genkloning var genet, der kodede for Taq DNA-polymerasen, blevet klonet og udtrykt i Escherichia coli. Dette har i høj grad lettet produktionen af rekombinant Taq-polymerase og reduceret prisen på dette enzym til passende anvendelse.
Figur 1: Taq Polymerase
DNA-polymerase er et enzym, der katalyserer syntesen af DNA fra nukleotider. Det er det mest nøjagtige enzym, der er ansvarligt for at duplikere genomer og videregive genetisk information til afkom. Under celledeling duplikerer DNA-polymerase alt dets DNA og overfører en kopi til hver dattercelle. I 1955 blev Arthur Kornberg opdaget DNA-polymerase i E coli. Funktionen af DNA-polymerase afhænger af flere krav; skabelon-DNA, mg+2 ioner, alle fire typer deoxynukleotider (dATP, dTTP, dCTP og d GTP) og en kort sekvens af RNA (primer). Syntese af DNA'et udføres i retning af 5'to 3 'med DNA-polymerase.
DNA-polymeraser kan grupperes i syv forskellige familier: A, B, C, D, X, Y og RT (Reverse transcriptase). Retrovirus koder for RT; en usædvanlig DNA-polymerase, som har brug for en RNA-skabelon til DNA-syntese. Der er fem forskellige typer DNA-polymeraser, der findes i prokaryoter til forskellige roller i DNA-replikationen. DNA-polymerase 3 er ansvarlig for polymerisationen af den nye DNA-streng. DNA-polymerase 1 er ansvarlig for at reparere og lappe DNA. DNA-polymeraser 2, 4 og 5 er ansvarlige for reparation og korrekturlæsning af DNA. I eukaryoter er der 15 forskellige typer DNA-polymeraser. De inkluderer fem større familier.
Figur 2: DNA-polymerase
DNA-polymeraser anvendes til genkloning, PCR, DNA-sekventering, SNP-detektion, molekylær diagnostik osv. Taq-polymerase er en slags DNA-polymerase, som kan tolerere høje temperaturer og være tilgængelig til DNA-syntese uden nedbrydning.
Taq Polymerase vs DNA Polymerase | |
Taq DNA-polymerase er et enzym, der skaber DNA. Det er et termostabilt enzym, der findes i termofile | DNA-polymerase er et enzym, der letter DNA-replikationen og findes i både prokaryote og eukaryote organismer. |
Nedbrydning ved høje temperaturer | |
Taq-polymerase er aktiv ved høje temperaturer. | DNA-polymeraser nedbrydes ved protein denaturerende høje temperaturer. |
Brug | |
Dette er vidt brugt i PCR | Taq-polymerase erstattede DNA-polymerasen fra coli oprindeligt brugt i PCR. |
DNA-polymeraser er de enzymer, der syntetiserer DNA fra deoxynukleotider (byggesten af DNA), når skabelonen og primerne er tilgængelige. DNA-polymeraser kræves for at duplikere cellernes DNA og passere i identiske datterceller under celledelingen. DNA-polymeraser tilføjer nye nucleotider til 3'-enden af primeren og forlænger den nye DNA-strengsyntese i 5 'til 3' retning. Taq DNA-polymerase er et af et DNA-polymerase-enzym, der er meget nyttigt ved polymerasekædereaktion (PCR) -metode til DNA-amplifikation. E coli DNA-polymerase 1 blev anvendt tidligere til PCR, men kommerciel Taq-polymerase erstattede den på grund af dens høje specificitet af primerbinding ved forhøjede temperaturer og produktion af et højere udbytte af det ønskede produkt med mindre ikke-specifikt amplificeringsprodukt. Dette er forskellen mellem Taq Polymerase og DNA Polymerase.
Reference:
1.Ishino, Sonoko og Yoshizumi Ishino. "DNA-polymeraser som nyttige reagenser til bioteknologi - udviklingsforskningens historie på området." Grænser inden for mikrobiologi. Frontiers Media S.A., 2014. Web. 28. februar 2017
2 "Taq og andre termostabile DNA-polymeraser." Springer. Springer Netherlands, 1. januar 1970. Web. 28. februar 2017
3.Stillman, Bruce. "DNA-polymeraser ved replikationsgaflen i eukaryoter." Molekylær celle. U.S. National Library of Medicine, 9. maj 2008. Web. 28. februar 2017
4.EukaryoticDNAPolymerases - University of Oxford. ” N.p., n.d. Web. 28. februar 2017
Billede høflighed:
1. “Taq” af Adenosine - Eget arbejde (CC BY-SA 3.0) via Commons Wikimedia
2. "DNA-polymerase" Af Yikrazuul - Eget arbejde (CC BY-SA 3.0) via Commons Wikimedia