Den vigtigste forskel mellem målrettet og u målrettet proteomik er, at målrettet proteomik sigter mod at måle forekomsten af et specifikt protein, medens u målrettet proteomik ikke er målrettet mod et specifikt protein.
Proteomics er den store undersøgelse af proteiner, deres strukturer og funktioner. Det studerer hele proteinkomplementet i en celle, væv eller en organisme under specifikke forhold. Der er to typer proteomik som målrettet proteomik og ikke-målrettet proteomik.
1. Oversigt og nøgleforskel
2. Hvad er målrettede proteiner
3. Hvad er uorienterede proteiner
4. Ligheder mellem målrettede og u målrettede proteiner
5. Sammenligning ved siden af hinanden - Målrettet mod ikke-målrettet proteomik i tabelform
6. Resume
Som navnet antyder, er målrettet proteomik rettet mod et specifikt protein eller et peptid i en kompleks blanding af proteiner til analyse. Derefter analyserer den tilstedeværelsen og mængden af det forudvalgte specifikke protein. Denne metode er kun mulig for en prøve eller på tværs af flere prøver. Denne metode er egnet selv til en specifik gruppe proteiner. Det resulterer i mere præcise, kvantitative og følsomme data. Derudover producerer massespektrometri kombineret med målrettet proteomik mere nøjagtige pålidelige målinger. Denne metode bruger tredobbelt quadrupol-massespektrometer (QQQ) til sin analyse.
Figur 01: Proteomics
Målrettet proteomik er en passende metode, hvis du vil verificere, om et knockdown-mål faktisk er slået ned, eller når du vil kvantificere et bestemt protein / peptid i blodserum, cerebral væske eller i cellelysat osv. Du kan også bruge det, hvis du vil for at kontrollere, om et bestemt protein udtrykkes differentielt på tværs af prøver eller i et tidsforløbseksperiment.
U målrettet proteomik, som navnet nævner, er ikke målrettet mod et specifikt protein eller peptid til dets analyse. Opdag proteomics er et andet navn på Ungetgeted proteomics. Faktisk er det en mere 'global' analyse. Generelt er at udføre ikke-målrettet proteomik at besvare spørgsmålet “hvilket protein eller proteiner der er i denne prøve eller flere prøver?”. Denne metode er ikke følsom som målrettet proteomik. Men det kan identificere og måle mange proteiner inklusive nye proteiner. U målrettet proteomik kan producere både kvantitative og kvalitative målinger.
For det første er målrettet proteomik bestemmelse af tilstedeværelsen og mængden af et bestemt protein eller peptid i kompleks blanding af proteiner. I modsætning hertil er u målrettet proteomik den kvantitative og kvalitative undersøgelse af proteiner, der er til stede i en prøve eller prøver uden at målrette mod et bestemt protein. Målrettet proteomik udføres med forudvalgte eller målrettede proteiner, mens ikke-målrettet proteomik udføres for at finde ud af, hvilke typer proteiner i denne prøve. Derudover er målrettet proteomik mere følsom end ikke-målrettet proteomik.
Sammenfattende er målrettede og u målrettede proteomik to typer proteinstudier. Som deres navne antyder, er målrettet proteomik rettet mod et specifikt protein, mens u målrettet proteomik ikke er rettet mod et specifikt protein. Dette er forskellen mellem målrettet og målrettet proteomik.
1. "Målrettede proteomics." UC Davis Proteomics Core, tilgængelig her.
2. "Proteomics / Introduktion til Proteomics." Musikteori / tilstande - Wikibøger, åbne bøger til en åben verden, fås her.
1. ”Proteomics” af Xxl7441 på engelske Wikibooks - Overført fra en.wikibooks til Commons (Public Domain) via Commons Wikimedia