Det vigtigste forskel mellem Watson og Crick og Hoogsteen baseparring er det Watson og Cricks baseparring er den standardmåde, der beskriver dannelsen af basepar mellem puriner og pyrimidiner. I mellemtiden er Hoogsteen-baseparring en alternativ måde at danne basepar, hvor purinen har en anden konformation med hensyn til pyrimidin.
Et nukleotid har tre komponenter: en nitrogenagtig base, en pentosesukker og en fosfatgruppe. Der er fem forskellige nitrogenholdige baser og to pentose-sukkerarter involveret i strukturen af DNA og RNA. Når disse nukleotider danner en nukleotidsekvens, danner komplementære baser, enten puriner eller pyrimidiner, hydrogenbindinger mellem dem. Dette er kendt som baseparring. Derfor dannes et basepar ved sammenføjning af to nitrogenholdige baser med brintbindinger. Watson og Cricks baseparring er den klassiske eller standardmetode, mens Hoogsteen baseparring er en alternativ måde at danne basepar.
1. Oversigt og nøgleforskel
2. Hvad er Watson og Crick Base Parring
3. Hvad er Hoogsteen Base Parring
4. Ligheder mellem Watson og Crick og Hoogsteen Base Parring
5. Sammenligning side ved side - Watson og Crick vs Hoogsteen Base Parring i tabelform
6. Resume
Watson og Cricks baseparring er standardmetoden, der forklarer baseparringen af nitrogenholdige baser i nukleotider. James Watson og Francis Crick, i 1953, forklarede denne baseparingsmetode, som stabiliserer dobbeltstandarden helixer af DNA. Ifølge Watson- og Crick-baseparring danner adenin hydrogenbindinger med thymin i DNA og med uracil i RNA. Guanin danner desuden hydrogenbindinger med cytosin i både DNA og RNA.
Figur 01: Watson og Crick Base Parring
Der er tre hydrogenbindinger mellem G og C, mens der er to hydrogenbindinger mellem A og T. Disse basepar gør det muligt for DNA-helix at opretholde sin regelmæssige spiralformede struktur. De fleste nukleotidsekvenser (60%) har Watson- og Crick-basepar, der er stabile ved neutral pH.
Hoogsteen-baseparring er en alternativ måde at danne basepar i nucleinsyrer. Dette blev først beskrevet af den amerikanske biokemiker Karst Hoogsteen i 1963. Hoogsteen-basepar svarer til Watson- og Crick-basepar. De forekommer mellem adenin (A) og thymin (T) og guanin (G) og cytosin (C). Men purin har en anden konformation med hensyn til pyrimidin. I A- og T-basepar drejes adeninet i 1800 om den glycosidiske binding, hvilket tillader et alternativt hydrogenbindingsskema. På lignende måde roteres guanin i G- og C-par 180 ° omkring den glycosidiske binding. Desuden er vinklen på glykosidbindinger større i Hoogsteen-basepar. Desuden er dannelsen af Hoogsteen-basepar ikke stabil ved neutral pH.
Figur 02: Watson og Crick Base Parring vs Hoogsteen Base Parring
Hoogsteen-basepar er ikke-kanoniske basepar, der gør nukleotidsekvenserne mindre stabile end standardbaseparringen. Desuden kan de resultere i forstyrrelse af DNA-dobbelt helix. Selvom Hoogsteen basepar forekommer naturligt, er de meget sjældne.
Watson- og Crick-baseparring er den almindelige måde, der beskriver dannelsen af basepar mellem puriner og pyrimidiner. På den anden side er Hoogsteen-baseparring en alternativ måde at danne basepar, hvor purinen har en anden konformation med hensyn til pyrimidin. Så dette er den vigtigste forskel mellem Watson og Crick og Hoogsteen baseparring. Watson og Crick baseparring blev beskrevet af James Watson og Francis Crick i 1953, mens Hoogsteen baseparring blev beskrevet af Karst Hoogsteen i 1963. Desuden er Watson og Crick basepar par stabile, mens Hoogsteen basepar er typisk mindre stabile.
Nedenstående infografisk opsummerer forskellen mellem Watson og Crick og Hoogsteen-baseparring.
Watson- og Crick-baseparring og Hoogsteen-baseparring er to typer måder, der beskriver dannelsen af nitrogenholdige baser i nukleotidsekvenser. Ved Hoogsteen-baseparring har purinbasen en anden konformation med hensyn til pyrimidinbase. Så dette er den vigtigste forskel mellem Watson og Crick og Hoogsteen baseparring. Derudover stabiliserer Watson- og Crick-basepar par DNA-dobbelthelix, mens Hoogsteen-basepar gør helixen ustabil. Begge typer basepar forekommer imidlertid naturligt, og de findes i ligevægt med hinanden.
1. “Hoogsteen Base Pair.” Wikipedia, Wikimedia Foundation, 9. januar 2020, tilgængelig her.
2. “Opdagelse af DNA-struktur og funktion: Watson og Crick.” Nature News, Nature Publishing Group, tilgængelig her.
1. “GC Watson Crick basepair” Af den originale uploader var WillowW på engelsk Wikipedia. - Overført fra en.wikipedia til Commons (CC BY-SA 3.0) via Commons Wikimedia
2. “Hoogsteen Watson Crick pairing-en” Af Ian Furst - Eget arbejde (CC BY-SA 4.0) via Commons Wikimedia