Forskellen mellem YAC- og BAC-vektorer

Nøgleforskel - YAC vs BAC-vektorer
 

Vektorer bruges i molekylær kloning. En vektor kan defineres som et DNA-molekyle, der opfører sig som et middel til at transportere fremmed genetisk materiale ind i en anden celle. En vektor, der indeholder fremmed DNA, er kendt som rekombinant DNA, og den skal have evnen til at replikere og udtrykke det i værtsorganismen. Gær kunstig kromosom (YAC) og bakterielt kunstigt kromosom (BAC) er to typer vektorer involveret i kloning. Den vigtigste forskel mellem YAC og BAC er den YAC er et kunstigt konstrueret vektorsystem, der bruger en specifik region af gærkromosom til at indsætte store segmenter af genetiske materialer i gærceller mens BAC er et kunstigt konstrueret vektorsystem, der bruger en bestemt region i E coli kromosom for at indsætte store segmenter af DNA i E coli celler.

INDHOLD
1. Oversigt og nøgleforskel
2. Hvad er YAC-vektorer
3. Hvad er BAC-vektorer
4. Sammenligning side ved side - YAC vs BAC-vektorer
5. Resume

Hvad er YAC-vektorer?

YAC (Gær kunstig kromosom) er et kunstigt bygget kromosom, der har evnen til at bære et stort segment af fremmed DNA og replikere inden for gærcellerne. Det har en centromere, telomerer såvel som autonomt replikerende sekvenser, der er essentielle for replikation og stabilitet. YAC bør også bære en selektiv markør eller markører og restriktionssteder for at gøre det til en effektiv kloningsvektor. En stor sekvens, der spænder fra 1000 kb til 2000 kb, kan indsættes i YAC og overføres til gær. Transformationseffektiviteten af ​​YAC er meget lav.

Figur 01: YAC Vector

Hvad er BAC-vektorer?

Bakterielt kunstigt kromosom (BAC) er et kunstigt konstrueret kromosom til molekylær kloning. Det har specifikke regioner i E coli F plasmid, og det er cirkulært og superrullet. BAC er udviklet til at klone DNA-fragmenter til bakterier, især til E coli. Det kan bære DNA-fragmenter med størrelser op til 300 kb. Sammenlignet med YAC er BAC-kloningsindsatser mindre i størrelser. BAC'er blev udviklet i 1992, og det er stadig populært på grund af dets stabilitet og lette konstruktion. BAC'er er også nyttige til udvikling af vacciner.

Figur 02: BAC-vektor i molekylær kloning

Hvad er forskellen mellem YAC og BAC vektorer?

YAC vs BAC vektorer
YAC er et genetisk manipuleret kromosom med anvendelse af gær-DNA til kloning.	BAC er et genetisk konstrueret DNA-molekyle, der bruger E coli DNA til kloning.
Køn
YAC'er blev designet til at klone store fragmenter af genomisk DNA i gær.	BAC'er blev udviklet til kloning af store genomiske fragmenter i Escherichia coli.
Indsæt længde
YAC'er kan indeholde megabase-størrelse genomiske insertioner (1000 kb - 2000 kb).	BAC'er kan bære indsatser på 200-300 kb eller derunder.
Konstruktion
YAC-DNA er vanskeligt at rense intakt og kræver høj koncentration til generering af YAC-vektorsystem.	BAC er let at rense intakt og kan let konstrueres.
kimærisme
YAC'er er ofte kimære.	BAC'er er sjældent kimæriske.
Stabilitet
YAC er ustabil.	BAC er stabil.
Ændringer
Gærrekombination er meget gennemførlig og forbliver altid aktiv. Derfor kan det generere sletninger og andre omarrangementer i en YAC.	E coli rekombination forhindres og tændes når det er nødvendigt. Derfor reducerer det de uønskede omarrangementer i BAC'er.
Vedligeholdelse
Manipulering af rekombinante YAC'er kræver normalt, at YAC overføres til E coli til efterfølgende manipulation. Derfor er det en møysommelig proces.	BAC-ændring sker direkte i E coli. Så der er ikke behov for DNA-overførsel. Derfor er processen ikke møysommelig.

Resume - YAC vs BAC vektorer

YAC er blevet et essentielt forskningsværktøj i kloneprocesser på grund af dets evne til at klone store fragmenter af DNA i værtsorganismen. YAC'er har imidlertid adskillige ulemper som vektorer såsom konstruktionsvanskeligheder, kimerisme, ustabilitet osv. Derfor har forskere udviklet BAC-vektorer for at overvinde disse problemer. BAC er konstrueret under anvendelse af specifikke regioner i E coli kromosom. Det er en stabil vektor og kan let konstrueres. Imidlertid er længden af ​​DNA, som BAC kan håndtere, op til 20 gange mindre end YAC. Dette er forskellen mellem YAC og BAC vektorsystemer. I dag er BAC mere foretrukket frem for YAC i laboratorierne.

Referencer
1. Shero, J. H., M. K. McCormick, S. E. Antonarakis og P. Hieter. "Gær kunstige kromosomvektorer til effektiv klonmanipulation og kortlægning." Genomics.U.S. National Library of Medicine, juni 1991. Web. 25 mar. 2017
2. Ramsay, M. "Gær kunstig kromosomkloning." Molekylær bioteknologi. U.S. National Library of Medicine, april 1994. Web. 25 mar. 2017

Billede høflighed:
1. “BACs kloningsvektorer Chem114A” Af Tinastella - (CC BY-SA 3.0) via Commons Wikimedia