Forskellen mellem VNTR og probe

Det vigtigste forskel mellem VNTR og sonde er det VNTR er en kort nukleotidsekvens, der forekommer som en tandem-gentagelse i genomet, mens en sonde er en kunstigt syntetiseret kort sekvens af DNA eller RNA, der kunne radioaktivt mærkes.

VNTR står for tandem gentagelse med variabelt tal. Det er en kort nukleotidsekvens organiseret i tandem gentagelser i genomet. VNTR'er forekommer naturligt i vores genom. En sonde er en kunstigt syntetiseret kort DNA- eller RNA-sekvens. Både sonde og VNTR er nukleinsyrer eller korte nukleotidsekvenser. De har enorm anvendelse i forskellige molekylærbiologiske teknikker, hovedsageligt i retsmedicinske undersøgelser. VNTR og sonde deler nogle ligheder såvel som forskelle. Derfor forsøger artiklen at fremhæve forskellen mellem VNTR og sonde.

INDHOLD

1. Oversigt og nøgleforskel
2. Hvad er en VNTR
3. Hvad er en sonde
4. Ligheder mellem VNTR og sonde
5. Sammenligning side ved side - VNTR vs sonde i tabelform
6. Resume

Hvad er en VNTR?

VNTR er en kort nukleotidsekvens, der findes som en tandem-gentagelse i vores genom. VNTR'er findes i mange kromosomer. Endvidere adskiller VNTR'er sig fra forskellige individer fra længderne, da antallet af gentagelser er forskelligt i VNTR'er for forskellige mennesker. Grundlæggende skyldes det alleler, der er arvet fra deres forældre. Derfor bruger vi hovedsageligt VNTR'er til identifikation af forældre (arv) eller til personlige formål. Tilsvarende er det også muligt at bruge dem i genetik, retsmedicin, biologisk forskning og DNA-fingeraftryk. Derfor er VNTR et vigtigt redskab i molekylærbiologi.

Figur 01: VNTR

I arv analyserer vi VNTR-data ved hjælp af to grundlæggende principper: arvsmatching og identitetstilpasning. Under arvematchning skal den enkelte have en matchende allel til hver forældres. Under identitetstilpasning skal begge VNTR-alleler være til stede på en bestemt placering af genomet.

Hvad er en sonde?

I forbindelse med molekylærbiologi er en sonde et kunstigt syntetiseret DNA- eller RNA-fragment med en længde på 100 til 1000 baser. Vi kan radioaktivt mærke disse sonder. Derfor bruger vi dem til at detektere målnukleotidsekvenser, der er komplementære til sondens sekvens. Når vi tilføjer sonder til prøven, finder hybridisering sted med de komplementære sekvenser eller målsekvenser og gør det let for os at identificere målsekvenserne. Da prober har radioaktivitet, kan vi let registrere dem.

Figur 02: Probe

I retsmedicinsk videnskab bruger vi ofte sonder i DNA-profileringsteknikker såsom påvisning af korte tandem-gentagelsesregioner, restriktionsfragmentlængdepolymorfismer og DNA-fingeraftryk.

Hvad er ligheden mellem VNTR og Probe?

• Nukleinsyrer er byggestenene til VNTR og Probe.
• Vi bruger dem i genidentifikationsprocesser.
• Begge deres længder er også varierende.
• De er vigtige redskaber i retsmedicinske undersøgelser, DNA-fingeraftryk, genetik osv.

Hvad er forskellen mellem VNTR og probe?

VNTR er en region i genomet, der er organiseret som tandem-gentagelser, mens en sonde er en kort DNA- eller RNA-sekvens, der er syntetiseret kunstigt for at detektere målsekvenser i en prøve. Så dette er den vigtigste forskel mellem VNTR og sonde. En vigtig forskel mellem VNTR og sonde er også, at i modsætning til VNTR'er, kan vi radioaktivt mærke sonderne.

Desuden udfører VNTR'er for det meste forældreidentifikation, medens prober hjælper med at detektere målnukleotidsekvenser i DNA- eller RNA-prøver, der er komplementære til sekvensen af ​​sonden. Derfor er dette også en signifikant forskel mellem VNTR og sonde.

Følgende infographic viser mere information om forskellen mellem VNTR og sonde.

Resume - VNTR vs Probe

Den almindelige anvendelse af VNTR og sonde er i molekylæranalyseteknikker såsom retsmedicinske undersøgelser og DNA-fingeraftryk. Begge består af variable længder. Imidlertid er den vigtigste forskel mellem VNTR og sonde, at en VNTR er et område af genomet arrangeret med tandem-gentagelser, mens en sonde er et fragment af DNA eller RNA, der kunne radioaktivt mærkes. Derudover er VNTR'er til stede i genomet. Men prober syntetiseres kunstigt og kunne mærkes radioaktivt for at detektere målnukleotidsekvenser i DNA- eller RNA-prøver, der er komplementære til sekvensen i sonden. Dette er således resuméet af forskellen mellem VNTR og sonde.

Reference:

1. "Variabelt antal gentagelser fra tandem (VNTR) og dets anvendelse i bakteriel epidemiologi." Videnskabsvarsel: Tidsskrift, tilgængelig her.
2. "DNA-sonde." Nature News, Nature Publishing Group, tilgængelig her.

Billede høflighed:

1. “D1S80Demo” Af PaleWhaleGail på engelsk Wikipedia (CC BY-SA 3.0) via Commons Wikimedia
2. “Molecular Beacons” (CC BY-SA 3.0) via Commons Wikimedia