Det vigtigste forskel mellem aktivt sted og bindingssted er det et aktivt sted hjælper med at katalysere en kemisk reaktion, hvorimod et bindingssted hjælper med bindingen af en ligand til et stort molekyle.
Et bindingssted er et område på et protein, DNA eller RNA, hvortil en ligand kan binde. Enzymer er proteiner. Et aktivt sted er et område på et enzym, hvortil substraterne kan binde for at gennemgå en kemisk reaktion. Denne specifikke region har også et bindingssted sammen med et katalytisk sted. Derfor hjælper bindingssteder kun med bindingen af en ligand til et stort molekyle, hvorimod aktive steder hjælper både bindingen af en ligand til et stort molekyle, mens det lader den gennemgå en katalyseret kemisk reaktion.
1. Oversigt og nøgleforskel
2. Hvad er et aktivt sted
3. Hvad er bindende sted
4. Sammenligning side ved side - Aktivt sted vs bindende sted i tabelform
5. Resume
Det aktive sted er et område på et enzym, hvortil substraterne af en kemisk reaktion binder for at gennemgå en katalyseret kemisk reaktion. denne region består af to underregioner som et bindingssted og et katalytisk sted. Bindingsstedet indeholder nogle rester, der kan hjælpe bindingen af substratet (reaktanter) på enzymet. Det katalytiske sted hjælper med at katalysere den kemiske reaktion. Desuden er denne region meget lille sammenlignet med hele enzymets volumen; 10-20% af hele enzymets volumen.
Figur 01: Det bindende sted og det katalytiske sted på et aktivt sted
Normalt indeholder det aktive sted 3-4 aminosyrer. resten af aminosyrerne i enzymet involveret i opretholdelse af enzymets tertiære struktur. Mere vigtigt er, at et aktivt sted har et specifikt design, der kan passe til et specifikt underlag. Derfor reagerer disse enzymer kun med bestemte substrater. Men nogle gange har enzymer brug for kofaktorer for deres funktion. Hovedfunktionen af det aktive sted er at reducere aktiveringsenergien ved en kemisk reaktion og derved øge reaktionshastigheden.
Bindingssted er et område på et protein, DNA eller RNA, hvortil ligander kan binde. Der kan liganden danne en kemisk binding med dette sted. Disse regioner viser specificitet; en bestemt ligand vil binde til et bestemt bindingssted. Derfor er dette sted et mål for de typer ligander, der kan binde med et molekyle.
Desuden bruger vi ofte disse regioner til funktionel karakterisering af biomolekyler. For eksempel kan vi karakterisere funktionaliteten af et aktivt sted gennem dets bindende sted. I tilfælde af DNA er den specifikke type bindingssted endvidere transkriptionsfaktorbindingsstedet til stede på DNA'et.
Aktivt sted er et område på et enzym, hvortil substraterne i en kemisk reaktion binder sig for at gennemgå en katalyseret kemisk reaktion, hvorimod bindingsstedet er et område på et protein, DNA eller RNA, hvortil ligander kan binde. Dette er den vigtigste forskel mellem aktivt sted og bindingssted. Desuden er de aktive steder til stede på enzymer, og de hjælper med at forøge reaktionshastigheden for en bestemt kemisk reaktion ved at reducere aktiveringsenergibarrieren for denne reaktion. Bindingssteder er derimod ansvarlige for bindingen af en specifik ligand med et bestemt molekyle.
Nedenstående infografik viser forskellen mellem aktivt sted og bindingssted i tabelform.
Aktive steder er regioner på enzymer, der kan øge reaktionshastigheden for en kemisk reaktion ved at reducere aktiveringsenergibarrieren for denne reaktion. Et bindingssted er ethvert område, hvortil en ligand kan binde. Aktivt sted indeholder også et bindende sted. Forskellen mellem aktive websteder og bindende websteder ligger på eksistensen og funktionaliteten. Derfor er den vigtigste forskel mellem aktivt sted og bindingssted, at et aktivt sted hjælper katalysen af en kemisk reaktion, hvorimod et bindingssted hjælper med bindingen af en ligand til et stort molekyle.
1. "Aktivt websted." Wikipedia, Wikimedia Foundation, 24. juli 2018. Tilgængelig her
2. "Bindende sted." Wikipedia, Wikimedia Foundation, 28. august 2018. Tilgængelig her
1. ”Enzymstruktur” Af Thomas Shafee - Eget arbejde, (CC BY 4.0) via Commons Wikimedia