Forskellen mellem Gen-knockout og Knockdown

Det vigtigste forskel mellem gen knockout og knockdown er, at gen-knockout er en teknik, hvor genet af interesse fjernes fuldstændigt (inoperativ tilstand) at undersøge genets funktioner mens gen knockdown er en anden teknik, hvor genet af interesse tystes at undersøge det specifikke gens rolle i et biologisk system.

Forskellige genetiske teknikker er i drift for at undersøge funktionen af ​​gener i de levende biologiske systemer. Gen knockout og knockdown er to sådanne teknikker. Disse teknikker hjælper forskere med at identificere funktionelle aspekter af forskellige gener i levende organismer.

INDHOLD

1. Oversigt og nøgleforskel
2. Hvad er Gen Knockout
3. Hvad er Gen Knockdown
4. Ligheder mellem genetisk knockout og knockdown
5. Sammenligning side ved side - Gen knockout vs knockdown i tabelform
6. Resume

Hvad er Gen Knockout?

Gen knockout er en genetisk teknik, der gør en eller flere gener uvirksomme i levende organismer. Dette er også en proces med at slukke eller slette et gen fra en organisme. Den primære anvendelse af denne teknik er at studere genfunktionen. Processen evaluerer virkningen af ​​det mistede eller fjernede gen. Knockout-processen involverer også visse enzymer og splejsningsteknikker.

Figur 01: Gen Knockout

Der er få variationer i genet knockout-teknikken baseret på antallet af involverede gener. De er dobbelt knockout (knockout af to gener), tredobbelt knockout (knockout af tre gener) og firdoblet knockout (knockout af fire gener). Gen-knockout klassificeres yderligere i to grupper; heterozygote knockouts og homozygote knockouts.

Hvad er Gen Knockdown?

Gen knockdown er en eksperimentel procedure, hvor denne procedure undertrykker eller reducerer ekspressionen af ​​et bestemt gen eller gener af en organisme. Gendæmpning er den almindelige definition for gennedslag. Under denne procedure involverer aktivering eller nedbrydning af det producerede mRNA RNA-interferens (RNAi), lille interfererende RNA (siRNA) og kort hårnåle-RNA (shRNA).

Figur 02: Genstille

Den primære anvendelse af gennedbrydning er at undersøge den særlige gens rolle i det biologiske system. Derfor gennemfører denne teknik undersøgelsen af ​​onkogener (Bcl-2 og P53) og gener, der forårsager neurologiske sygdomme, virusinfektioner og arvelige sygdomme.

Hvad er lighederne mellem Gen-knockout og Knockdown?

• Både gen knockout og gen knockdown er genetiske teknikker.
• Disse to teknikker kan forhindre genekspression.
• Den primære anvendelse af begge teknikker er at undersøge funktionen af ​​genet af interesse.
• Begge er i stand til at identificere forskellige sygdomsforhold (genetiske).
• De kunne begge bruges til en eller flere gener af interesse.

Hvad er forskellen mellem genetisk knockout og knockdown?

Gen Knockout vs Knockdown
Gen knockout er i drift af gener (fjernelse af gener fra DNA) fra en organisme gennem forskellige genetiske teknikker.	Gen knockdown er en eksperimentel procedure til at undertrykke (reducere eller tavse) ekspressionen af ​​et bestemt gen eller gener af en organisme.
Fungere
Letter studiet af genfunktioner ved at analysere resultaterne af det tabte gen.	Letter studiet af onkogener, gener, der forårsager neurologiske sygdomme, virusinfektioner og arvelige sygdomme.
Inddragelse af RNA-agenter
Involvering af RNA-midler er ubetydelig i denne teknik.	Processen involverer midlerne såsom siRNA, shRNA og RNAi til inaktivering af mRNA.
Brug af kemiske stoffer
Enzymatiske midler anvendes.	Ingen sådanne kemiske stoffer anvendes.
Effekt på gen
Fjerner genet helt fra DNA'et.	Undertrykk eller dæmp genet.
Klassifikation
Dobbelt knockout, triple knockout og firedoblet knockout og heterozygot og homozygot knockout er forskellige typer gen knockout.	Der findes ingen sådanne klassificeringssystemer til gendæmpning.

Resume - Gen Knockout vs Gen Knockdown

De to teknikker, vi diskuterede her; genet knockout og knockdown, er metoder til at undersøge funktionerne af forskellige gener. Gen knockout gør genet fuldstændigt inaktivt, mens gen knockdown tavser genet af interesse. Begge procedurer forhindrer imidlertid genekspression. Forskellige midler er i stand til at gennemføre disse to processer. Gen knockout er en type deletion, mens gen knockdown er en type inaktivering. Dette er forskellen mellem gen knockout og knockdown.

Reference:

1.Shaffer, Catherine. "Gen Knockout versus Knockdown." News-Medical.net, 12. februar 2018. Tilgængelig her  
2. "Gen Knockout." Nature News, Nature Publishing Group. Tilgængelig her

Billede høflighed:

1.'Knockout Mice5006-300'By Maggie Bartlett, NHGRI. (Public Domain) via Commons Wikimedia 
2.'RNAi-forenklet'By Matzke MA, Matzke AJM (2004) Plante frø af et nyt paradigme. PLoS Biol 2 (5): e133 doi: 10.1371 / journal.pbio.0020133., (CC BY 2.5) via Commons Wikimedia