Det vigtigste forskel mellem genkortlægning og gensekvensbestemmelse er det genmapping er en teknik, der identificerer placeringen af et gen i genomet og afstandene mellem gener, mens gensekventering er en teknik, der identificerer den nøjagtige rækkefølge af nukleotider i et gen.
Genkortlægning og gensekventering er vigtig i genetisk diagnostik for at lokalisere og bekræfte tilstedeværelsen af gener. Molekylære teknikker såsom gelelektroforese og polymerasekædereaktion spiller således vigtige roller i udledningen af et genkort. Endvidere er brugen af forskellige sekventeringsteknikker, såsom Sanger-sekventering og Next-Generation-sekventering essentiel for at generere en gensekvens.
1. Oversigt og nøgleforskel
2. Hvad er genetisk kortlægning
3. Hvad er gensekventering
4. Ligheder mellem genetisk kortlægning og gentekventering
5. Sammenligning side ved side - Genkortlægning vs genekventering i tabelform
6. Resume
Genkortlægning er teknikken til at generere et komplet kort over placeringen af gener i et kromosom. Kromosomkortlægning er et synonym for genkortlægning. Yderligere giver denne teknik information om de specifikke gener, der er lokaliseret i kromosomet. Derudover bruger genmapping fysiske kortlægningsmetoder under kortlægningsprocessen.
Figur 01: Genkortlægning
Genkortlægning kan hjælpe med at finde kromosomale afvigelser. Derfor fungerer det genetiske kort som et diagnostisk værktøj til at detektere tilstande som Downs syndrom og Turners syndrom osv. Karyotyping er en teknik, der kan bruges til at generere et genetisk kort. Farvning er en vigtig teknik til generering af et genetisk kort, hvor der bruges pletter såsom ethidiumbromid, acridin orange og Giemsa. Genkortlægning kan også generere linkningskort, hvor identifikation af placeringen af de forbundne gener finder sted.
Gensekventering er den teknik, der anvendes til at identificere og deducere den nøjagtige baseparssekvens af genet. Således kan man gennem gensekvensbestemmelse aflede rækkefølgen af adenin-, guanin-, thymin- og cytosinbaser i en sekvens. Den første helgenom-sekventering fandt sted i mikroorganismer. Det menneskelige genomsekventeringsprojekt var et af vendepunktene i molekylærbiologiens historie. På nuværende tidspunkt spiller gensekventering en vigtig rolle inden for industri og medicinske områder. Dette bekræfter nøjagtigt tilstedeværelsen af et bestemt gen i genomet.
Figur 02: Genekventering
Der er forskellige teknikker til sekvens af et gen. Maxam og Gilbert var pionerer for at introducere en kemisk metode til sekvensgener eller DNA. Anvendelse af potentielt farlige kemikalier fører imidlertid til, at den kemiske sekventeringsteknik afbrydes. Senere introducerede Sanger en sekventeringsteknik, der ikke brugte farlige kemikalier. Imidlertid spiller automatiseret sekventering og næste generations sekventering på nuværende tidspunkt vigtige roller i at trække sekvensen af et bestemt gen.
Den vigtigste forskel mellem genkortlægning og gensekvensering er den information, de to teknikker genererer. Genkortlægning tilvejebringer information om placeringen af et bestemt gen i et kromosom, mens gensekvensering genererer information om sekvensen af basepar af et specifikt gen. Begge teknikker spiller imidlertid en rolle i karakteriseringen af et gen. Således er tiden og omkostningerne, der tages for afslutningen af de to teknikker, forskellige.
Nedenstående infografisk opsummerer forskellen mellem genkortlægning og gensekvensbestemmelse.
Genkortlægning og gensekventering er to teknikker, der hjælper med at karakterisere et gen. Mens et genkort gør det muligt at lokalisere genet, tilvejebringer gensekvensen de biokemiske data for det pågældende gen. Genkortlægning og gensekventering er meget vigtig i genetiske undersøgelser og genetisk diagnostik. Desuden er begge teknikker nu automatiserede for at sikre, at teknikkerne er hurtige og nøjagtige. Informationen, der genereres gennem genkortlægning og gensekvensering, anvendes i nedstrømsprocesser under molekylær diagnostik.
1. Brown, Terence A. “Mapping Genomes.” Genomer. 2. udgave. U.S. National Library of Medicine, 1. januar 1970, tilgængelig her.
2. “DNA Sequencing Technologies” Nature News, Nature Publishing Group, tilgængelig her.
1. “NHGRI Fact Sheet- Genetic Mapping (27058469495)” Af National Human Genome Research Institute (NHGRI) fra Bethesda, MD, USA - NHGRI Fact Sheet: Genetic Mapping (CC BY 2.0) via Commons Wikimedia
2. “154044” (CC0) via Pixabay