Integrerede proteiner vs perifere proteiner
Proteiner betragtes som makromolekyler, der består af en eller flere polypeptidkæder. Polypeptidkæderne består af aminosyrer, der er bundet sammen af peptidbindinger. Den primære struktur af et protein kan bestemmes ved aminosyresekvensen. Visse gener koder for mange proteiner. Disse gener bestemmer sekvensen af aminosyre og bestemmer derved deres primære struktur. Integrerede og perifere proteiner betragtes som 'plasmamembranproteiner' på grund af deres forekomst. Disse proteiner er generelt ansvarlige for en celles evne til at interagere med det ydre miljø.
Integreret protein
Integrerede proteiner findes hovedsageligt enten fuldstændigt eller delvist nedsænket i phospholipiderne i to lag i plasmamembranen. Disse proteiner har både polære og ikke-polære områder på dem. Polare hoveder stikker ud fra overfladen af dobbeltlaget, mens ikke-polære regioner er indlejret i det. Normalt interagerer kun de ikke-polære regioner med den hydrofobe kerne i plasmamembranen ved at frembringe hydrofobe bindinger med fedtsyretalerne i phospholipiderne.
De integrerede proteiner, der spænder over hele membranen fra den indre overflade til den ydre overflade kaldes transmembranproteiner. I transmembranproteiner er begge ender, der rager ud af lipidlaget polære eller hydrofile regioner. De midterste regioner er ikke-polære og har hydrofobe aminosyrer på deres overflade. Tre typer interaktioner hjælper med at indlejre disse proteiner i lipid-dobbeltlaget, nemlig ioniske interaktioner med de polære hoveder af phospholipidmolekyler, hydrofobe interaktioner med de hydrofobe haler af phospholipidmolekyler og specifikke interaktioner med visse regioner af lipider, glycolipider eller oligosaccharider.
Perifert protein
Perifere proteiner (ekstinsiske proteiner) er til stede på det inderste og yderste af phospholipider i to lag. Disse proteiner er løst bundet til plasmamembranen enten direkte ved interaktion med polære hoveder af phospholipider i lag eller indirekte ved interaktion med integrerede proteiner. Disse proteiner udgør ca. 20-30% af de totale membranproteiner.
De fleste af de perifere proteiner findes på den inderste overflade eller cytoplasmatiske overflade af membranen. Disse proteiner forbliver afgrænset af enten gennem kovalente bindinger med fedtkæder eller gennem et oligosaccharid til phospholipider.
Hvad er forskellen mellem integreret og perifert protein?
• Perifere proteiner forekommer på overfladen af plasmamembranen, mens integrerede proteiner forekommer enten helt eller delvist nedsænket i lipidlaget af plasmamembranen.
• Perifere proteiner er løst bundet til lipid-dobbeltlaget og interagerer ikke med den hydrofobe kerne mellem to lag fosfolipider. I modsætning hertil er integrerede proteiner tæt bundet og interagerer direkte med den hydrofobe kerne i plasmamembranen. På grund af disse grunde er integreret proteindissociation vanskeligere end perifere proteiner.
• Mild behandlinger kan bruges til at isolere perifere proteiner fra plasmamembranen, men til isolering af integrerede proteiner er milde behandlinger ikke nok. For at bryde de hydrofobe bindinger kræves detergenter. Integrerede proteiner kan således isoleres fra plasmamembranen.
• Efter isolering af disse to proteiner fra plasmamembranen kan perifere proteiner opløses i neutrale vandige buffere, mens integrerede proteiner ikke kan opløses i neutrale vandige buffere eller aggregater.
• I modsætning til perifere proteiner er integrerede proteiner forbundet med lipid, når de opløses.
• Eksempler på perifere proteiner er spektrin af erythrocytter, cytochrome C og ATP-ase af mitochondria og acetylcholinesterase i elektroplaxmembraner. Eksempler på integrerede proteiner er membranbundne enzymer, lægemiddel- og hormonreceptorer, antigen og rhodopsin.
• Integrerede proteiner repræsenterer omkring 70%, mens perifere proteiner repræsenterer den resterende del af plasmamembranproteiner.