Forskellen mellem RNASE A og RNASE H

Nøgleforskel - RNASE A vs RNASE H

Ribonukleaserne er nukleaser, der specifikt nedbryder RNA til mindre enheder. De kan opdeles i to kategorier; endoribonukleaser og exoribonukleaser. Endoribonuclease er en endonuclease, der enten kan nedbryde enkeltstrenget eller dobbeltstrenget RNA. Det spalter phosphodiesterbindingerne i en RNA-polynukleotidkæde. Eksemplerne er RNase A, RNase III, RNase T1, RNase P og RNase H. Exoribonuclease er en exonuclease, der nedbrydede RNA ved at fjerne terminale nukleotider fra enten 5'end eller 3'end af RNA-molekylet. Eksemplerne er RNase R, RNase II, RNase D og RNase PH. Det vigtigste forskel mellem RNASE A og RNASE H er, at RNase A er en pancreas-ribonuklease, der specifikt nedbryder enkeltstrenget RNA til mindre komponenter, mens RNase H er et ikke-specifikt enzym, der spalter RNA i RNA-DNA-hybrid i mindre enheder via den hydrolytiske mekanisme.

INDHOLD

1. Oversigt og nøgleforskel
2. Hvad er RNASE A
3. Hvad er RNASE H
4. Ligheder mellem RNASE A og RNASE H
5. Sammenligning side ved side - RNASE A vs RNASE H i tabelform
6. Resume

Hvad er RNASE A?

RNase A er en pancreas-ribonuklease, der specifikt spalter de uparrede cytosin- og uracilrester ved 3'-enden af enkeltstrenget RNA. RNase H fungerer ved en højere saltkoncentration (0,3 M eller højere NaCl-koncentration). Den hydrolytiske reaktion er to trin. Det danner et 3 'phosphoryleret produkt via 2', 3 'cyklisk monophosphatmellemprodukt. Selvom det er specifikt for enkeltstrenget RNA ved højere saltkoncentration, kan det også nedbryde dobbeltstrenget RNA og RNA i RNA-DNA-hybrid ved lavere NaCl-koncentration (lavere end 0,3M NaCI).

Bruce Merrifield syntetiserede først dette enzym. RNase A er et meget populært enzym i molekylær forskning. Bovin bugspytkirtel RNase A er et eksempel på RNase A. Og det er en af de hårdeste enzymer, der bruges i laboratoriet. Dette enzym har ikke brug for en cofactor for sin aktivitet. Det er et meget termostabilt enzym. RNase A er det første enzym og det tredje protein, hvortil der blev påvist en korrekt aminosyresekvens. Dette enzym er meget lille med 124 aminosyrer og molekylmasse 12600da. Og det har fire histidinrester (His 12 og His 119, der involverer en katalytisk reaktion).

Figur 01: RNase A

RNase A kan isoleres ved kogning af en rå prøve. Når koger nedbrydes alle andre enzymer, der er tilbage RNase A. RNase A er et utroligt stabilt enzym. Dette enzym inhiberer med ribonucleaseinhibitorprotein, tungmetal- og uridinvanadatkomplekser.

Hvad er RNase H?

RNase H er et ikke-specifikt ribonuclease-enzym, der kan nedbryde RNA i RNA-DNA-hybrid via hydrolytisk reaktion. RNase H spalter 3'- O-P-bindingen af RNA i en RNA-DNA-hybrid. I sidste ende producerer det 3'OH og 5 'phosphatterminerede produkter. Ved DNA-replikation spiller det en central rolle ved at fjerne RNA-primer, efter at nye DNA-strenge er dannet. Under laboratorieforhold nedbrydes det specifikt RNA i RNA-DNA-hybrid, men ikke DNA og uhybridiseret RNA. Og dette enzym bruges normalt til at ødelægge RNA-skabelonen, efter at den første komplementære DNA-streng er dannet under cDNA-syntese.

Figur 02: RNase H

RNase H anvender også i nuclease-beskyttelsesassays. Det kan også inkorporeres til fjernelse af poly A-hale fra mRNA. RNase H har evnen til at ødelægge det ikke-kodende RNA inden i og uden for cellen. Metalionerne kræves som cofaktorer til denne proteinaktivitet. En chelator (EDTA) kan bruges til at hæmme RNase H-enzymet.

Hvad er ligheden mellem RNASE A og RNASE H?

Begge har protein i naturen.
Begge er endoribonuklease
Begge kan nedbryde RNA.
Begge udfører hydrolytiske reaktioner.
Molekylære laboratorier bruger begge disse.

Hvad er forskellen mellem RNASE A og RNASE H?

RNASE A vs RNASE H
RNase A er en pancreas-ribonuklease, der specifikt spalter 3'-enden af uparret cytosin- og uracilrester af enkeltstrenget RNA ved højere saltkoncentration.	RNase H er et ikke-specifikt ribonucleaseenzym, der kan nedbryde RNA i RNA-DNA-hybrid via hydrolytisk reaktion.
RNA-spaltningens art
RNase A spalter specifikt enkeltstrenget RNA ved højere saltkoncentration.	RNase H spalter RNA i RNA-DNA-hybrid.
Behov for medfaktorer til aktivitet
RNase A har ikke brug for cofaktorer til sin aktivitet.	RNase H har brug for metalioner som cofaktorer for sin aktivitet.
Inhibitorer af proteinaktivitet
Ribonuclease-inhibitorprotein-, tungmetal- og uridin-vanadatkomplekser hæmmer RNAse A-aktiviteten.	En chelator (EDTA) inhiberer RNase H-aktivitet.
RNA-primerfjernelse i DNA-replikation
RNase A bruges ikke til RNA-primerfjernelse i DNA-replikation.	RNase H anvendes til fjernelse af RNA-primer i DNA-replikation
Fjernelse af DNA-skabelon i komplementær DNA (C-DNA) syntese
RNase A bruges ikke til RNA-template-fjernelse under komplementær DNA (C-DNA) syntese.	RNase H bruges til RNA-template-fjernelse under komplementær DNA (C-DNA) -syntese.
Fjernelse af poly-A-hal i mRNA hybridiseret til Oligo (dt)
RNase A bruges ikke til at fjerne “poly-A hale” i mRNA hybridiseret til oligo (dt).	RNase H bruges til at fjerne “poly-A hale” i mRNA hybridiseret til oligo (dt)

Resumé - RNASE A vs RNASE H

Ribonukleaserne er nucleaseenzymer, der har evnen til at spalte RNA i mindre enheder. De er to typer; endoribonukleaser og exoribonukleaser. Endoribonuclease er en endonuclease, der har evnen til at nedbryde enkeltstrenget eller dobbeltstrenget RNA. Og det spalter phosphodiesterbindingen i en RNA-polynukleotidkæde. RNase A og RNase H er to endoribonukleaser. RNase A er en pancreas-ribonuklease, der specifikt spalter uparret cytosin- og uracilrester ved 3'-enden af det enkeltstrengede RNA ved højere saltkoncentration. RNase H er et ikke-specifikt ribonuclease-enzym, der kan nedbryde RNA i RNA-DNA-hybrid via hydrolytisk reaktion. Dette er forskellen mellem RNase A og RNase H.

Download PDF RNASE A vs RNASE H

Du kan downloade PDF-version af denne artikel og bruge den til offline-formål som pr. Citatnotat. Download PDF-version her Forskel mellem RNASE A og RNASE H

Reference:

1.Karuturi, forfatter Amrutha. “17 har brug for at kende fakta om RNase A.” AG Blog, 22. februar 2017. Findes her
2. ”Ribonuclease.” Wikipedia, Wikimedia Foundation, 5. januar 2018. Tilgængelig her

Billede høflighed:

1.'RNase A'By Ingen forfatter, der kan læses af maskinen. Vossman antog (baseret på ophavsretskrav)., (CC BY-SA 2.5) via Commons Wikimedia
2.'RNase H fix'By Ingen forfatter, der kan læses af maskinen. Vossman antog (baseret på ophavsretskrav)., (CC BY-SA 2.5) via Commons Wikimedia

Videnskab & natur