Forskel mellem opstrøms og nedstrøms DNA

Nøgleforskel - Upstream vs Downstream DNA
 

Det er vigtigt at have en generel viden om sammensætningen og strukturen af ​​DNA for at forstå forskellen mellem opstrøms og nedstrøms DNA. DNA er sammensat af polynukleotidkæder. Nukleotider er byggestenene, der skaber polynukleotidkæder, og hvert nukleotid er lavet af tre komponenter: en fem-carbon sukker, en nitrogenholdig base og en fosfatgruppe. En phosphatgruppe og en OH-gruppe er bundet til henholdsvis 5'-positionskulstof og 3'-positionskulstof i sukkermolekylet i et nukleotid. Nukleotider forbindes sammen af ​​phosphodiesterbindinger dannet mellem 5'-phosphatgruppe af et nukleotid og 3 'OH-gruppe af det tilstødende nukleotid. Hvis en polynukleotidkæde har en fri 5'-phosphatgruppe, tildeles den som 5'-enden; hvis den har en fri 3 'OH-gruppe, tildeles den som en 3'-ende. Derfor har DNA-strenge normalt 5 'og 3' ender i overensstemmelse med polynukleotidkædens slutpositioner. DNA findes også som dobbeltstrenget form. To strenge er antiparallelle med hinanden. Derfor har DNA to strenge, der løber i 5 'til 3' retning og 3 'til 5' retning. Opstrøms og nedstrøms DNA refereres til med henvisning til transkription og syntese af 5 'til 3' mRNA streng. Hvis DNA overvejes mod den 5 ende af den kodende streng fra transkriptionsinitieringsstedet, er det kendt som opstrøms DNA. Hvis DNA overvejes mod 3'-enden fra den kodende streng fra transkriptionsinitieringsstedet er kendt som nedstrøms DNA. Dette er den vigtigste forskel mellem opstrøms og nedstrøms DNA.

INDHOLD
1. Oversigt og nøgleforskel
2. Hvad er opstrøms DNA
3. Hvad er downstream-DNA
4. Sammenligning side ved side - Opstrøms vs Downstream DNA
5. Resume

Hvad er opstrøms DNA?

Et gen er en strukturel og funktionel arvhed, der er placeret på DNA fra en organisme. Det opbevares med instruktioner til konstruktion af et protein. Genet har en specifik region af et DNA-molekyle. Når det er nødvendigt, transkriberes det og oversættes til et protein via syntese af en mRNA-streng. Normalt løber en kodende streng af genet fra 5 'til 3' retning. Når det transkriberes, producerer det en mRNA-streng i samme retning 5 'til 3'. Under transkriptionen tjenes 3 'til 5' antisense-streng som skabelonstreng og initierer mRNA-syntesen. Der er et transkriptionsinitieringssted i genet. Med henvisning til transkriptionsinitieringsstedet er DNA-regionen mod 5'-enden af ​​den kodende streng kendt som opstrøms DNA. En promotor af genet er normalt placeret i den opstrøms region af DNA. I eukaryote gener er der TATA-bokse, promotor-proximale elementer og enhancere i området opstrøms for genet. Genets opstrøms region henvises med negative tal. Opstrøms DNA af et gen er yderst vigtigt for transkriptionen.

Hvad er downstream DNA?

Transkriptionsinitieringssted er kendt som +1 punkt for et gen. DNA-regionen fra +1 punkt mod 3'-enden af ​​den kodende streng er kendt som nedstrøms DNA. Med andre ord er nedstrøms for genet fra transkriptionsinitieringsstedet mod 5'-enden af ​​skabelonstrengen. Derfor inkluderer nedstrøms DNA fra en genregion transkriptionel enhed og andre sekvenser, såsom terminatorsekvens. Promotoren kan påvirke et gens downstream-sekvens. Nedstrøms del af et gen henvises med positive tal. Nedstrøms DNA af et gen er den egentlige region, der giver proteinproduktet.

Figur 01: Opstrøms og nedstrøms DNA

Hvad er forskellen mellem Upstream og Downstream DNA?

Opstrøms vs Downstream DNA
DNA-region mod 5'-enden af ​​den kodende sekvens fra transkriptionsinitieringsstedet er kendt som opstrøms DNA.	DNA-region mod 3'-enden af ​​den kodende streng fra transkriptionsinitieringsstedet er kendt som nedstrøms DNA.
elementer
Promotorer og enhancers er placeret på opstrøms DNA	Transkriptionsenhed og terminatorsekvenser er placeret i nedstrøms DNA.
Nummerering
Nukleotider i den opstrøms region omtales med negative tal	Nukleotider henvises til med positive tal.
Fungere
Denne region indeholder elementer, der er nødvendige for at regulere og igangsætte transkription	Denne region indeholder instruktion om at fremstille et protein og afslutte transkriptionen

Resume - Upstream vs Downstream DNA

Det er let at identificere opstrøms og nedstrøms for en RNA-streng. Med hensyn til referencestedet er området mod 5'-enden af ​​RNA-strengen kendt som opstrøms RNA, hvorimod region mod 3'-enden er kendt som nedstrøms RNA. I DNA er der imidlertid to strenge, der kører i begge retninger 5 'til 3' og 3 'til 5'. Derfor er forskellen mellem opstrøms og nedstrøms DNA kompliceret. Derfor differentieres det med henvisning til transkription af et gen. Fra transkriptionsinitieringsstedet mod 5-enden af ​​sensstrengen er DNA-region kendt som opstrøms-DNA, medens fra transkriptionsinitieringsstedet mod 3'-enden af ​​sensstrengen er kendt som nedstrøms-DNA. Dette er forskellen mellem opstrøms og nedstrøms for DNA.

Referencer:
1. Rhee, Amy C., Benjamin H. Somerlot, Neeta Parimi og Jonatha M. Gott. "Særlige roller for sekvenser opstrøms for og nedstrøms fra Physarumediting-steder." RNA. Cold Spring Harbor Laboratory Press, september 2009. Web. 18. mar. 2017

Billede høflighed:
1. Barbosa, Cristina, Isabel Peixeiro og Luísa Romão. "Genekspressionsregulering efter opstrøms åbne læserammer og menneskelig sygdom." PLOS Genetik. Public Library of Science, n.d. Web. 18. mar. 2017.