Reverse transkriptionspolymerasekædereaktion (RT-PCR)
Fremskridt inden for bioteknologi har resulteret i opdagelsen af flere måder at imødekomme kravene til organtransplantationer gennem årene. Før kunne en person, der frivilligt donerede ethvert organ umiddelbart efter døden til en patient i nød, kun starte operationen for transplantationer. Biologers kontinuerlige undersøgelser og forskning fører til opdagelsen af stamceller.
Stamceller henviser til dem, der er taget fra DNAet fra et embryo, der vil tjene som kilde til regenerering af celler, der dybest set ville være en klon af det organ, hvor DNA'et er hentet. Mens menneskerettighedsaktivister lobbyer for at standse sådanne procedurer, har vellykkede operationer faktisk bevist effektiviteten af stamcelleudviklingen i organtransplantationer.
Inden man kan forstå og fuldt ud forstå stamceller, er der imidlertid behov for at blive bekendt med de forskellige terminologier, der er forbundet med denne videnskabelige opdagelse. Dyrkning af stamceller handler med DNA og dets kodning. Derfor er det vigtigt for studerende eller personer, der er interesseret i området, at skelne mellem RT-PCR og qPCR.
Reverse transkriptionspolymerasekædereaktion (RT-PCR) er en af de mange varianter af polymerasekædereaktionen eller PCR. Denne laboratorieteknik er vidt brugt i molekylærbiologi for at forskerne kan producere flere kopier af en bestemt DNA-sekvens gennem en proces, der er opfundet som "amplifikation". Forskellen mellem RT-PCR og traditionel PCR er, at RNA først transkriberes omvendt til dets DNA-komplement, der anvender reverse transkriptase. Det nye komplementære DNA, der indeholder den reverserede transkription, amplificeres derefter under anvendelse af den traditionelle PCR eller realtid PCR.
De fleste studerende, der studerer denne proces, begår ofte fejlen ved at udskifte omvendt transkription PCR og realtids PCR, da de to forkortes på lignende måde. For at undgå forvirring mærker biologer realtids PCR som kvantitativ realtid PCR eller qPCR.
QPCR adskiller sig meget fra RT-PCR, da qPCR er ansvarlig for at måle amplifikation, når den forekommer. Det kan siges, at RT-PCR starter amplificeringsprocessen, mens qPCR måler den, efterhånden som proceduren finder sted.
Kvantitativ realtid PCR
QPCR har faktisk revolutioneret den traditionelle envejsfremgangsmåde, når det kommer til kvantificering af DNA og RNA, da anvendelse af qPCR-metoden gør det muligt for biologer at bestemme den indledende koncentration af nukleinsyren, selv før resultaterne af reaktionen er blevet observeret og noteret ned.
Anvendelsen af qPCR, der nu betragtes som den mest kraftfulde og følsomme analyseteknik til genetiske undersøgelser, er blevet udvidet markant. Det er i øjeblikket involveret i kvantitativ genekspressionsanalyse, genotyping, patogen påvisning og analyse af SNP sammen med RNA-interferensmålinger.
QPCR kombineres ofte med processen med omvendt transkription for at kvantificere messenger-RNA og MicroRNA, der er til stede i cellerne i væv, der er observeret og eksperimenteret med. Dette giver derefter en anden synlig forskel mellem de to: RT-PCR kan bruges til amplificeringsprocessen, men det skal smeltes sammen med qPCR til kvantificeringsformål.
QPCR er også kendt for at være mere kvantitativ, da dataene kan indsamles, efterhånden som eksponentiel vækst (log) -fasen for PCR skrider frem. Biologer bemærker, at mængden af biprodukt af PCR er direkte proportional med mængden af skabelonnukleinsyre, der vil blive målt gennem qPCR.
På den anden side er RT-PCR langt fra at have en kvantitativ karakter, da overholdelsen af intensiteten af det amplificerede bånd på en gel efter den indstillede standard for en koncentration kan føre til at have en "semi-kvantitativ" inferens.
1.QPCR og RT-PCR er begge udtryk anvendt i bioteknologi og brugt til produktion af flere kopier af DNA.
2.RT-PCR bruges til at amplificere den reverserede transkription af DNA-koden; QPCR måler amplifikationen.
3.RT-PCR er til amplifikation, mens qPCR er til kvantificering.
4.QPCR er kvantitativ, mens RT-PCR ikke er det.