Forskel mellem maksimal parsarie og maksimal sandsynlighed

Det vigtigste forskel mellem maksimal parsimon og maksimal sandsynlighed afhænger af metoden, der anvendes til at udvikle det fylogenetiske træ. Maksimal parsimon fokuserer på at minimere de samlede karaktertilstande under den fylogenetiske trækonstruktion, mens den maksimale sandsynlighed er en statistisk tilgang til at tegne det fylogenetiske træ afhængigt af sandsynligheden for genetiske data.

Filogeni er den nye tilgang til klassificering og nomenklatur af organismer. Filogeni er afhængig af genetiske data og evolutionære forhold. De genetiske data er et resultat af DNA-sekventering. I fylogeni foregår klassificering af organismer baseret på den fælles stamfar. Maksimal parsimonium og maksimal sandsynlighed for et fylogenetisk forhold øger nøjagtigheden og pålideligheden af ​​et fylogenetisk træ.

INDHOLD

1. Oversigt og nøgleforskel
2. Hvad er maksimal parlamentarik 
3. Hvad er maksimal sandsynlighed
4. Ligheder mellem maksimal parsession og maksimal sandsynlighed
5. Sammenligning ved siden af ​​hinanden - Maksimal parsimon vs maksimal sandsynlighed i tabelform
6. Resume

Hvad er maksimal parsession?

I teknikken med maksimal parsimon foregår minimeringen af ​​de totale karaktertilstandsændringer under den fylogenetiske analyse. Phylogenetic er en gren af ​​biologi, der beskæftiger sig med at studere evolutionære relationer. Et fylogenetisk træ er et træ, der viser de evolutionære forhold, der er baseret på en fælles stamfar. Når man tegner et fylogenetisk træ ved hjælp af begrebet maksimal parsimonie, minimeres mængden af ​​paralleludvikling. Derfor vil maksimal parsimonie generere træet meget hurtigere end andre metoder. Det skyldes, at kun de vigtigste kendetegn, der tages i betragtning, tages i betragtning i maksimal parsimonium.

Figur 01: Maksimal persimens

Når man tegner et maksimalt parsimonious træ, er træet altid det kortest mulige træ med det mindste antal taxa. Pålideligheden af ​​et maksimalt parsimonious træ er imidlertid meget høj. Den statistiske konsistens og nøjagtigheden af ​​det fylogenetiske forhold baseret på maksimal parsimon vil variere. Der er desuden komplekse algoritmer, der analyserer den maksimale parsimonie for et fylogenetisk forhold.

Hvad er maksimal sandsynlighed?

Maksimal sandsynlighed er en af ​​de mest anvendte statistiske metoder, der analyserer fylogenetiske forhold. Metoden analyserer fylogeni baseret på sandsynlighedsmodellen. Denne metode tager endvidere hensyn til både middelværdi og varians. Således opnås maksimal sandsynlighed for phylogeni på de givne genetiske data for en bestemt organisme.

Figur 02: Maksimal sandsynlighed

Der er både fordele og ulemper ved at bruge den statistiske metode med størst mulig sandsynlighed. Metoden er meget passende, når man analyserer et simpelt datasæt, der indeholder genetisk information. Når graden af ​​varians mellem de genetiske data er lavere, er de maksimale sandsynlighedsresultater pålidelige. Resultaterne, der er genereret gennem maksimal sandsynlighed, bekræfter yderligere den maksimale parsimoniums score for et specifikt fylogenetisk forhold. Derfor fungerer maksimal sandsynlighedsanalyse som en bekræftende test.

I sammenligning med fordelene nævnt ovenfor er denne metode en langsom og intens proces. I mangel af et enkelt datasæt er fejludgangen endvidere høj. Således gør det også reproducerbarheden af ​​resultaterne ved den mest sandsynlige estimering.

Hvad er lighederne mellem maksimal persimens og maksimal sandsynlighed?

• Maksimal parsimonie og maksimal sandsynlighed er to tilgange, der spiller en vigtig rolle i fylogeni.
• Begge teknikker afbilder forholdet mellem en organisme og dens stamfar baseret på de tilgængelige genetiske data.
• Filogenetiske træer kan fortolkes ved hjælp af både maksimal parsimonie og maksimal sandsynlighed.
• I begge teknikker er de genetiske data afhængige af DNA-sekventering eller RNA-sekventering.
• Begge metoder er vigtige for generering af fylogenetiske træer.

Hvad er forskellen mellem maksimal persimens og maksimal sandsynlighed?

Både maksimal parsimonium og maksimal sandsynlighed er to forskellige fremgangsmåder til fortolkning af et fylogenetisk træ. Maksimal parsimonium tror på at analysere få karakteristika og minimere karakterændringerne fra organisme til organisme. I modsætning hertil tager metoden med maksimal sandsynlighed både gennemsnit og variansen i betragtning og opnår maksimal sandsynlighed for de givne genetiske data for en bestemt organisme. Så dette er den vigtigste forskel mellem maksimal parsimonium og maksimal sandsynlighed.

Desuden er pålideligheden af ​​maksimal parsimonium alene ikke tilstrækkelig til at udlede en konklusion. Men metoden med maksimal sandsynlighed fungerer som en bekræftende test af resultaterne af maksimal parsimon. Konklusioner bør derfor gøres ved hjælp af både maksimal parsimonium og maksimal sandsynlighed.

Nedenstående infografik opsummerer forskellen mellem maksimal parsimonium og maksimal sandsynlighed.

Sammendrag - Maksimal persimens vs maksimal sandsynlighed

Filogeni spiller en vigtig rolle i at udlede evolutionære forhold ved at konstruere fylogenetiske træer. Maksimal parsimonie er teknikken til at konstruere et træ med det mindste antal karaktertilstandsændringer. I modsætning hertil afhænger den maksimale sandsynlighed for et fylogenetisk træ på at bruge den maksimale lighed mellem genetiske data. Dataene til begge analyser kommer fra DNA- eller RNA-sekvensdataene. Pålideligheden og nøjagtigheden er høj, når trækonstruktionen finder sted ved hjælp af begge teknikker. Dette opsummerer således forskellen mellem maksimal parsimonium og maksimal sandsynlighed.

Reference:

1. Elliott. ”Konkurrence mellem forbrydelse og sandsynlighed.” OUP Akademisk, Oxford University Press, 1. august 2004, tilgængelig her.

Billede høflighed:

1. “Maximum parsimon tree of haplogroup B2b” Af Taboada-Echalar P, Álvarez-Iglesias V, Heinz T, Vidal-Bralo L, Gómez-Carballa A, Catelli L, et al. (2013) Den genetiske arv fra den pre-koloniale periode i moderne bolivianske. PLoS ONE 8 (3): e58980. doi: 10.1371 / journal.pone.0058980 (CC BY 2.5) via Commons Wikimedia
2. “Maksimum-sandsynlighedstræ fra Lactarius blennius og relativationer” Af bruger: Thkgk - Eget arbejde (CC0) via Commons Wikimedia