Transposon vs Retrotransposon
Transposoner og retrotransposoner er genetiske komponenter af DNA, og der er store forskelle mellem dem. Den procentvise tilstedeværelse af disse genetiske materialer varierer mellem arterne, og deres funktioner bestemmer skæbnen for organismen med mutationer og andre fænotypisk vigtige ændringer. Transposoner og retrotransposoner er gener eller samlinger af visse gener placeret i DNA-strengene, og ændringer af deres placering har været de vigtigste årsager til disse konsekvenser. Denne artikel har imidlertid til hensigt at diskutere funktionerne af disse gener kort og præsenterer en sammenligning mellem transposoner og retrotransposoner.
Hvad er Transposon?
Transposoner er interessante fragmenter eller segmenter af DNA med evnen til at ændre placeringen af DNA-strengen i form af en skære- og pastamekanisme. På grund af denne mobile karakter af transposonerne er disse kendt som springende gener. Transposoner er af to hovedtyper kendt som klasse I Transposoner og Klasse II Transposoner. Normalt omtales klasse II-typen som transposoner, og klasse I-typen betegnes retrotransposoner. Processerne til at skære og indsætte mobile DNA-segmenter reguleres af enzymet transposase. Enzymet binder til begge ender af transposonet og skærer fosfodiesterbindingerne i DNA-strengen, isolerer transposonet, flytter det til målstedet og binder det nye sted. Imidlertid er denne proces interessant at forstå, da nogle transposoner kun kan flytte til bestemte placeringer på grund af uforeneligheden af basesekvenser med målsiden. Gener med den ene ende af en enkelt streng har den samme basesekvens med den anden ende af den anden enkle streng er transposoner med klæbrige kanter, fordi disse kan binde til stederne i mål-DNA-strengen med den samme basesekvens som i de klistrede ender . Imidlertid kan denne mobilitet af gener forårsage ændringer i genotypen såvel som i fænotypen af organismen. Forskere opfandt om transposoner og genetisk modificerede fødevarer og organismer i henhold til de foretrukne tilpasninger blev derefter gjort tilgængelige. Meget produktive landbrugsafgrøder, antibiotika med medicinske egenskaber, husdyr var nogle af de fordelagtigt udviklede produkter efter opfindelsen af transposoner af Barbara McClintock i 1940'erne.
Hvad er Retrotransposon?
Retrotransposoner er klasse I-transposoner, og disse bevæger sig gennem genomet gennem mekanismen til kopiering og indsætning. Mekanismen for mobilitet af retrotransposoner involverer få store trin, såsom kopiering af gensegmentet af DNA-strengen til RNA, overførsel af kopien af RNA til målsiden, transkription af RNA-sekvensen tilbage til DNA ved hjælp af revers transkriptase og insertion af genet ind i den nye placering af DNA-streng i genomet. De to ender af disse retrotransposoner har normalt lange terminale gentagelser med ca. 1000 basepar, og disse bruges som identifikationsegenskaber for disse gener. Disse gener amplificeres let inde i genomet, og procentdelen af retrotransposoner i det humane genom er ca. 50%. Disse kan være ret farlige, da den forårsagende virus af AIDS-, HIV- og T-celle leukæmi-virus har retrotransposoner i deres RNA-genomer. Faktisk kan disse vira binde retrotransposonerne til ethvert sted i de humane DNA-strenge med anvendelse af omvendt transkriptase og integrase. Integrase-enzymet fungerer på samme måde som transposase i transposoner i klasse II.
Hvad er forskellen mellem Transposon og Retrotransposon? • Transposoner er klasse II-hoppegener, mens retrotransposoner falder i kategorien af klasse I. • Transposoner fungerer med transposase-enzymet, mens retrotransposoner fungerer ved anvendelse af to hovedenzymer, kendt som omvendt transkriptase og integrase. • Terminalenderne er meget længere i retrotransposoner end i transposoner. • Transposoner skæres fra oprindelsen og indsættes på målet; omvendt kopieres retrotransposoner fra oprindelsen til RNA og transkriberes ved målet. • Bevægelsen af retrotransposoner involverer RNA, men ikke i transposoner. |